Adversarial attacks on voter model dynamics in complex networks 査読有り 国際誌

Chiyomaru K, Takemoto K

Physical Review E ( American Physical Society )   106 ( 1 )   014301-1 - 014301-6   2022年07月

Simple black-box universal adversarial attacks on deep neural networks for medical image classification 査読有り 国際誌

Koga K, Takemoto K

Algorithms   15 ( 5 )   144-1 - 144-12   2022年04月

Natural images allow universal adversarial attacks on medical image classification using deep neural networks with transfer learning 査読有り 国際誌

Akinori Minagi, Hokuto Hirano, Kazuhiro Takemoto

Journal of Imaging   8 ( 2 )   38-1 - 38-15   2022年02月

Backdoor attacks to deep neural network-based system for COVID-19 detection from chest X-ray images 査読有り 国際誌

Matsuo Y, Takemoto K

Applied Sciences   11 ( 20 )   9556-1 - 9556-10   2021年10月

ネットワーク伝播による生物ネットワーク解析 招待有り 査読有り

千代丸勝美, 竹本和広

JSBi Bioinformatics Review   1 ( 2 )   26 - 36   2021年04月

Diversity of dominant soil bacteria increases with warming velocity at the global scale 査読有り 国際誌

Kanzaki Y, Takemoto K

Diversity   13 ( 3 )   120-1 - 120-11   2021年03月

Universal adversarial attacks on deep neural networks for medical image classification 査読有り 国際誌

Hirano H, Minagi A, Takemoto K

BMC Medical Imaging   21   9-1 - 9-13   2021年01月

Vulnerability of deep neural networks for detecting COVID-19 cases from chest X-ray images to universal adversarial attacks 査読有り 国際誌

Hirano H, Koga K, Takemoto K

PLoS ONE   15 ( 12 )   e0243963-1 - e0243963-15   2020年12月

Simple iterative method for generating targeted universal adversarial perturbations 査読有り 国際誌

Hirano H, Takemoto K

Algorithms   13 ( 11 )   268-1 - 268-10   2020年10月

The brain-derived neurotrophic factor Val66Met polymorphism increases segregation of structural correlation networks in healthy adult brains 査読有り 国際誌

Ueda I, Takemoto K, Watanabe K, Sugimoto K, Ikenouchi A, Kakeda S, Katsuki A, Yoshimura R, Korogi Y

PeerJ   2020年08月

Revisiting the hypothesis of an energetic barrier to genome complexity between eukaryotes and prokaryotes 査読有り 国際誌

Chiyomaru K, Takemoto K

Royal Society Open Science   7   191859-1 - 191859-9   2020年02月

Simple iterative method for generating targeted universal adversarial perturbations 査読有り 国際誌

Hirano H, Takemoto K

Proceedings of 25th International Symposium on Artificial Life and Robotics   426 - 430   2020年01月

Difficulty in inferring microbial community structure based on co-occurrence network approaches 査読有り

Hirano H, Takemoto K

BMC Bioinformatics   20   329-1 - 329-14   2019年06月

Ecological Networks 招待有り 査読有り 国際誌

Takemoto K, Iida M

Reference Module in Life Sciences   2019年04月

Brain structural connectivity and neuroticism in healthy adults 査読有り

Ueda I, Kakeda S, Watanabe K, Sugimoto K, Igata N, Moriya J, Takemoto K, Katsuki A, Yoshimura R, Abe O, Korogi Y

Scientific Reports (Nature Publishing Group)   8   16491-1 - 16491-8   2018年11月

A network biology-based approach to evaluating the effect of environmental contaminants on human interactome and diseases 査読有り

Iida M, Takemoto K

Ecotoxicology and Environmental Safety   160   316 - 327   2018年09月

Network resilience of mutualistic ecosystems and environmental changes: an empirical study 査読有り

Nagaishi E, Takemoto K

Royal Society Open Science   5   180706-1 - 180706-12   2018年09月

Decomposing the effects of ocean environments on predator-prey body-size relationships in food webs 査読有り

Dobashi T, Iida M, Takemoto K

Royal Society Open Science   5   180707-1 - 180707-10   2018年07月

MAPLE 2.3.0: an improved system for evaluating the functionomes of genomes and metagenomes 査読有り

Arai W, Taniguchi T, Goto S, Moriya Y, Uehara H, Takemoto K, Ogata H, Takami H

Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry   82 ( 9 )   1515 - 1517   2018年05月

PREvaIL, an integrative approach for inferring catalytic residues using sequence, structural and network features in a machine learning framework 査読有り

Song J, Li F, Takemoto K, Haffari G, Akutsu T, Chou K-C, Webb G I

Journal of Theoretical Biology   443   125 - 137   2018年04月

Large-scale aggregation analysis of eukaryotic cytosolic proteins reveals an involvement of intrinsically disordered regions in protein folding 査読有り

Uemura E, Niwa T, Minami S, Takemoto K, Fukuchi S, Machida K, Imataka H, Ueda T, Ota M, Taguchi H

Scientific Reports (Nature Publishing Group)   8   678-1 - 678-11   2018年01月

Limitations of a metabolic network-based reverse ecology method for inferring host-pathogen interactions 査読有り

Takemoto K, Aie K

BMC Bioinformatics   18   278-1 - 278-9   2017年05月

代謝ネットワークを用いた微生物生態系の可視化

竹本和広

実験医学増刊 ( 羊土社 )   35 ( 5 )   211 - 214   2017年03月

代謝ネットワークの数理モデルとその応用

竹本和広

応用数理 ( 岩波書店 )   24 ( 1 )   10 - 18   2014年03月

代謝ネットワークのロバストネス

竹本和広

細胞工学 ( 学研メディカル秀潤社 )   33 ( 1 )   31 - 36   2014年01月

Current understanding of the formation and adaptation of metabolic systems based on network theory

Takemoto K

Metabolites ( MDPI )   2 ( 3 )   429 - 457   2012年07月

代謝ネットワーク形成の理解に向けて

竹本和広

実験医学増刊 ( 羊土社 )   29 ( 7 )   180 - 185   2011年04月

Measuring structural robustness of metabolic networks under a boolean model using integer programming and feedback vertex sets 査読有り

Tamura T., Takemoto K., Akutsu T.

Proceedings of the International Conference on Complex, Intelligent and Software Intensive Systems, CISIS 2009   819 - 824   2009年10月

Effects of feedback and feedforward loops on dynamics of transcriptional regulatory model networks 査読有り

Oosawa C., Takemoto K., Savageau M.

Proceedings of the 13th International Symposium on Artificial Life and Robotics, AROB 13th'08   885 - 890   2008年12月

Local cause of coherence in Boolean networks 査読有り

Oosawa C., Takemoto K., Matsumoto S., Savageau M.

Proceedings of the 12th International Symposium on Artificial Life and Robotis, AROB 12th'07   621 - 626   2007年12月

ブーリアンネットワークにおけるモチーフ構造の埋め込みの効果 査読有り

大澤 智興, 竹本 和広

電子情報通信学会技術研究報告. NLP, 非線形問題 ( 一般社団法人電子情報通信学会 )   107 ( 349 )   1 - 6   2007年11月

M<SUB>3</SUB>: Merging Module Model for a Network with Scale-Free Properties and Modularity 査読有り

Takemoto Kazuhiro, Oosawa Chikoo

Ｇｅｎｏｍｅ　Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ ( 日本バイオインフォマティクス学会 )   14   378 - 379   2003年01月

グローバルな情報を加味するセマンティックセグメンテーションとラベルの重複を許す分類のジョイントの学習

平野北斗, 竹本和広, 大北剛

第23回情報論的学習理論ワークショップ (IBIS 2020) 

環境変動と土壌マイクロバイオームの関係についての全球規模解析

神崎祥昭, 竹本和広

2020年日本バイオインフォマティクス学会年会・第９回生命医薬情報学連合大会 

肺炎診断用深層ニューラルネットワークのバックドア攻撃に対する脆弱性

松尾優希, 平野北斗, 竹本和広

2020年日本バイオインフォマティクス学会年会・第９回生命医薬情報学連合大会 

精神疾患リスクと環境パラメータの関連性についての地理空間データ分析

伊東拓海, 竹本和広

2020年日本バイオインフォマティクス学会年会・第９回生命医薬情報学連合大会 

転移学習された医用画像分類モデルの普遍的敵対的摂動に対する脆弱性

三奈木啓成, 平野北斗, 竹本和広

2020年日本バイオインフォマティクス学会年会・第９回生命医薬情報学連合大会 

Universal Adversarial Perturbation を用いた COVID-19 診断用深層ニューラルネットワークの信頼性評価

平野北斗, 三奈木啓成, 竹本和広

2020年日本バイオインフォマティクス学会年会・第９回生命医薬情報学連合大会 

Simple iterative method for generating targeted universal adversarial perturbations

Hirano H, Takemoto K

25th International Symposium on Artificial Life and Robotics (AROB 25th 2020) 

原核生物-真核生物間のエネルギー障壁の統計解析

千代丸勝美, 竹本和広

日本生体エネルギー研究会第45回討論会 

Universal Adversarial Perturbationを用いた医療画像診断用ディープニューラルネットワークの信頼性評価

平野北斗, 三奈木啓成, 竹本和広

第22回情報論的学習理論ワークショップ (IBIS 2019) 

転移学習された画像分類モデルのUniversal Adversarial Perturbationに対する脆弱性：病理画像診断を例にして

三奈木啓成, 平野北斗, 竹本和広

第22回情報論的学習理論ワークショップ (IBIS 2019) 

Stability of ecological communities: A network perspective

Bioinformatics Seminar Series  2017年07月 

代謝ネットワークから解き明かす生物—環境相互作用：解析基盤の確立と応用

研究課題番号：25700030  2013年04月 - 2017年03月   若手研究(A)

統計力学に基づく生化学反応ネットワークの解析とモデル化

研究課題番号：07J00209  2007年04月 - 2009年03月   特別研究員奨励費

2022年度   AI医療・創薬概論

2021年度   計算・統合生物学特論

2021年度   数値計算(B)

2021年度   人工知能Ｂ

2021年度   数値計算演習

2021年度   離散数学Ⅱ

2020年度   計算・統合生物学特論

2020年度   科学技術英語Ⅰ

2020年度   数値計算(B)

2020年度   人工知能Ｂ

2020年度   数値計算演習

2020年度   離散数学Ⅱ

2019年度   計算・統合生物学特論

2019年度   数値計算演習

2019年度   人工知能

2019年度   数値計算

2019年度   離散数学Ⅱ

2018年度   離散数学Ⅱ

2018年度   数値計算

2018年度   人工知能

2018年度   数値計算演習

2018年度   計算・統合生物学特論

2017年度   数値計算

2017年度   計算・統合生物学特論

2017年度   数値計算演習

2017年度   人工知能

2016年度   数値計算演習

2016年度   人工知能

2016年度   数値計算

2015年度   人工知能

2014年度   人工知能