Conference Prsentations (Oral, Poster) -
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嫌気好気条件下での回分培養大腸菌の代謝動力学モデル
松岡結, 倉田博之
化学工学会第83回年会
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スマートセルインダストリーを指向した中心代謝系の定量的モデル
松岡結, 倉田博之
第6回生命医薬情報学連合大会
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A critical evaluation of bioinformatics tools for the prediction of protein succinylation sites
Md. Mehedi Hasan, Hiroyuki Kurata
Conference of Informatics In Biology, Medicine and Pharmacology (IIBMP2017)
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中心代謝反応系のコンピュータモデル:酸素制限下での発酵性能
松岡結, 倉田博之
情報処理学会バイオ情報学研究会研究報告
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ネガティブフィードバック構造に基づく生物振動子の周期調節可能性の解析
前田和勲, 倉田博之
情報処理学会バイオ情報学研究会研究報告
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細胞工場のコンピュータ支援設計
倉田博之
化学工学会第49回秋季大会
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ノイズ下でロバストなメモリー機能を生み出す遺伝子ネットワーク機構の解明
Shamim Ul Hasan, 倉田博之
化学工学会第82回年会
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動的感度を用いたErbBシグナル伝達ネットワークのロバストネス解析
増永拓之、倉田博之
化学工学会第81回年会
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抗体産生を向上させるためのCHO 細胞代謝の数学モデリング
バッチャモハメド，杉本 友里恵，倉田 博之
第67回日本生物工学会大会
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抗体生産強化のためのCHO細胞メタボロームの統計解析
倉田博之
化学工学会第47回秋季大会
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アンモニア同化システムの詳細なダイナミックモデル
倉田博之
化学工学第80回年会
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マルチパラメータ感度を用いたネガティブフィードバック振動子のロバストネス解析
前田和勲
生命情報科学若手の会第6回研究会
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生物システムの合理的設計を支援するBioFNetデータベース
倉田博之
化学工学会第46回秋季大会
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生物学的基本ネットワークの組み立てによるダイナミックモデルの合理的設計
倉田博之
化学工学会第79年会
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ゲノムスケールヒト代謝ネットワークの高速エレメンタリモード解析
倉田博之
化学工学会第45回秋季大会
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合理的生物回路設計のためのバイオアルゴリズムデータベース
倉田博之
化学工学会第78年会
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アンモニア同化システムのダイナミックモデルの開発
倉田博之
化学工学会第77年会
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Grid layout algorithm for biochemical networks using approximate pattern matching
The 10-th International Conference on Bioinformatics (InCoB2011)
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Hybrid Grid Layout Algorithm For Biochemical. Network Maps
The 2011 annual conference of Japanese Society for Bioinformatics
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ゲノムネットワークを構成する全基本回路の構造と機能のデータベース化
倉田博之
化学工学会第43回秋季大会
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Dual Feedback Loop Architecture is a Robust and Entrainable Oscillator for Circadian Rhythm
The 12-th international Conference on Systems biology
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Use of elementary mode analysis predicts the flux distributions of a broad range of genetic mutants
The 12-th international Conference on Systems biology
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合成生物学のためのバイオアルゴリズムデータベース開発
倉田博之
化学工学会第76回年会
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Regulome database for systematic search of biological design principles
The 2010 annual conference of Japanese Society for Bioinformatics
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CADLIVE: A platform for network modeling and simulation of biological pathway
The 2010 annual conference of Japanese Society for Bioinformatics
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Flux Module-based Decomposition for Parameter Optimization in a Dynamic Model of Biochemical Networks
The 2010 annual conference of Japanese Society for Bioinformatics
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Development of elementary mode-based algorithms for designing a metabolic system
The 2010 annual conference of Japanese Society for Bioinformatics
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CADLIVE: Data Integrator with Network Layout Module
The 11-th international Conference on Systems biology
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Quasi-Multiparameter Sensitivity Analysis reveals Remarkable Robustness of Dual Feedback Circadian Oscillators
The 11-th international Conference on Systems biology
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Development of elementary mode-based algorithms for designing a metabolic system
Souma Tabata, Quanyu Zhao, Hiroyuki Kurata
The 9-th International Conference on Bioinformatics (InCoB2010)
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An integrative and practical strategy for optimizing a large-scale dynamic model of biochemical systems
The 9-th International Conference on Bioinformatics (InCoB2010)
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A Novel Spectral Clustering of Protein Interaction Networks
The 9-th International Conference on Bioinformatics (InCoB2010)
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Exploring huge parameter space of a large-scale model of biochemical networks
The 9-th International Conference on Bioinformatics (InCoB2010)
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多様な遺伝子組換え微生物における代謝流束分布の新規な予測法
倉田博之
化学工学会第42回秋季大会
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Genetic Modification of Flux: エレメンタリーモードを用いた組換え細胞の代謝流束予測
倉田博之
化学工学会第75年会
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Extended CADLIVE: Multi-User Framework and Data Integrator
The 20th International Conference on Genome Informatics
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Adjustable Diffusion Matrix-Based Spectral Clustering for Protein-Protein Interaction Network
The 20th International Conference on Genome Informatics
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Novel Robustness Analysis Reveals Remarkable Robustness of Dual Feedback Loops in a Circadian Clock
The 20th International Conference on Genome Informatics
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Module Decomposition and Integration Method Optimizes a Large-Scale Cell Cycle Model
The 20th International Conference on Genome Informatics
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Prediction of Transcriptional Patterns of Gene Deletion Mutants
The 20th International Conference on Genome Informatics
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生物学と工学の統合にむけて
倉田博之
化学工学会第41回秋季大会
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Searching multiple sets of kinetic parameters values reproducing target experimental data in dynamic biochemical models
The 2008 annual conference of Japanese Society for Bioinformatics
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Extended CADLIVE: Computer-aided rational design of living systems
The 2008 annual conference of Japanese Society for Bioinformatics
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Computer aided rational design of biochemical systems
The 21st Annual and International Meeting of the Japanese Association for Animal Cell Technology.
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創薬を指向した細胞周期モデルインテグレータ
倉田博之
化学工学会第40回秋季大会
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Computer-Aided Rational Design of Biochemical Networks in E. coli
UK-Japan Systems Biology workshop
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Parameter search of large-scale dynamic biochemical network models
The 2007 annual conference of Japanese Society for Bioinformatics
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CADLIVE : An integrative system of life information
The 2007 annual conference of Japanese Society for Bioinformatics
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Systems biology for analysis of nitrogen assimilation system in E. coli
The 2007 annual conference of Japanese Society for Bioinformatics
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Optimization of a large-scale cell cycle model using multi-objective GAs
The 2007 annual conference of Japanese Society for Bioinformatics
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Stochastic simulation of diffusion reaction model in embryo development
The 2007 annual conference of Japanese Society for Bioinformatics
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遺伝子発現プロファイルを統合する代謝流束予測法
倉田博之
化学工学会第39回秋季大会
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CADLIVE:Computer-Aided Design of Living Systems
The 15th annual international conference on intelligent systems for molecular biology
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細胞の代謝流束を予測・設計するためのゲノムスケール代謝経路解析法
本人
化学工学会第38回秋季大会
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Robustness analysis for the mechanism for a temperature-compensated circadian oscillator
20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology and 11 th FAOBMB Congress
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Dynamic simulation and robustness analysis for the E. coli nitrogen assimilation system
The 20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology and the 11 th FAOBMB Congress
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Automatically building and visualizing biochemical networks
The third Asia-Pacific Bioinformatics Conference
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大規模遺伝子制御・代謝ネットワークの動的モデルの最適化
本人
第5回システムバイオロジー研究会
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大腸菌窒素同化システムのシミュレーションとシステム解析
第4回システムバイオロジー研究会
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CADLIVE: A Direct Link of Biochemical Networks to Dynamic Simulations
12th International Conference of Intelligent Systems for Molecular Biology
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CADLIVE Simulatorを用いた窒素同化システムのマルチフィードバック解析
第26回日本分子生物学会年会
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Gillespie のアルゴリズムを用いた哺乳類細胞における時空間代並ⅸするの確率的シミュレーション
第26回日本分子生物学会年会
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CADLIVE：コンピュータ上での経路探索による突然変異体のシステム解析
第26回日本分子生物学会年会
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熱ショック応答システムのインターコネクトフィードバック制御
第26回日本分子生物学会年会
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生命分子間相互作用ネットワークをコンピュータ上で合成・解析するためのCADLIVEシステムの開発
第26回日本分子生物学会年会
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CADLIVE for designing metabolic and gene regulatory networks
The 9th Symposium of Young Asian Biochemical Engineers' Community
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Map-based dynamic simulator of gene regulatory networks
4th International Conference on Systems Biology
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CADLIVE for constructing a yeast cell cycle
11th International Conference of Intelligent Systems for Molecular Biology
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CADLIVE for constructing and simulating biochemical networks
11th International Conference of Intelligent Systems for Molecular Biology
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実数値遺伝的アルゴリズムのための優性方向優先探索
情報処理学会研究報告
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熱ショック応答システムにおけるフィードバック制御とフィードフォワード制御の戦略
第25回日本分子生物学会年会
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BIOCAD：生命設計支援システム
第25回日本分子生物学会年会
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BIOCAD for constructing gene regulatory networks
10th International Conference of Intelligent Systems for Molecular Biology
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BIOCAD for constructing gene regulatory networks
ISMB Satellite Meeting on Computer Modeling of Cellular Processes
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複雑な制御は生命システムのロバスト性を向上させる
第24回日本分子生物学会年会
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A two-phase partition method that simulates the dynamic behavior of the gene regulatory networks with high accuracy at a remarkably high speed
Proceedings of the Second International Conference on Systems Biology
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生命設計支援のための大規模シミュレータ開発
化学工学会第34回秋季大会
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Complexity in regulation generates the robustness in bacterial heat shock response
4th international Conference on Biological Physics
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Complexity in regulation generates the robustness in bacterial molecular network
Search for Logic of Life as Complex Systems
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A two-phase partition method simulates the dynamics behavior of the heat shock response with high accuracy at a remarkably high speed
9th International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology
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System analysis of complex molecular networks by mathematical simulation and control theory
9th International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology
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The two-phase partition method simulates a gene regulatory network at an extremely high speed
Pacific. Symp. Biocomputing