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IWATA Michio
 
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Affiliation
Faculty of Computer Science and Systems Engineering Department of Bioscience and Bioinformatics
Job
Associate Professor
External link

Research Interests

  • Machine learning

  • Drug repositioning

  • Gene expression

  • Tensor decomposition

  • Drug discovery

  • Biochemical System Theory

  • Systems biology

  • Mathematical modeling

  • Numerical calculation

  • Bioinformatics

Research Areas

  • Informatics / Life, health and medical informatics

  • Life Science / System genome science

Degree

  • 九州大学  -  博士(農学)   2014.03

Biography in Kyutech

  • 2022.09
     

    Kyushu Institute of Technology   Faculty of Computer Science and Systems Engineering   Department of Bioscience and Bioinformatics   Associate Professor  

Academic Society Memberships

  •   日本バイオインフォマティクス学会   Japan

Papers

  • De novo drug design based on patient gene expression profiles via deep learning Reviewed International journal

    Chikashige Yamanaka, Shunya Uki, Kazuma Kaitoh, Michio Iwata, Yoshihiro Yamanishi

    Molecular Informatics ( Molecular Informatics )   42   e202300064   2023.07

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)

    DOI: 10.1002/minf.202300064

    DOI: 10.1002/minf.202300064

  • Regulome-based characterization of drug activity across the human diseasome Reviewed International journal

    Iwata M., Kosai K., Ono Y., Oki S., Mimori K., Yamanishi Y.

    npj Systems Biology and Applications   8 ( 1 )   2022.12

     More details

    Authorship:Lead author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)

    DOI: 10.1038/s41540-022-00255-4

    Scopus

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  • Pathway trajectory analysis with tensor imputation reveals drug-induced single-cell transcriptomic landscape Reviewed International journal

    Iwata M., Mutsumine H., Nakayama Y., Suita N., Yamanishi Y.

    Nature Computational Science   2 ( 11 )   758 - 770   2022.11

     More details

    Authorship:Lead author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)

    DOI: 10.1038/s43588-022-00352-8

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  • Small compound-based direct cell conversion with combinatorial optimization of pathway regulations Reviewed International journal

    Nakamura T., Iwata M., Hamano M., Eguchi R., Takeshita J.I., Yamanishi Y.

    Bioinformatics (Oxford, England)   38 ( 2 )   ii99 - ii105   2022.09

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)

    DOI: 10.1093/bioinformatics/btac475

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  • From drug repositioning to target repositioning: Prediction of therapeutic targets using genetically perturbed transcriptomic signatures Reviewed International journal

    Namba S., Iwata M., Yamanishi Y.

    Bioinformatics   38   I68 - I76   2022.07

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)

    DOI: 10.1093/bioinformatics/btac240

    Scopus

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  • TRANSDIRE: Data-driven direct reprogramming by a pioneer factor-guided trans-omics approach Reviewed International journal

    Eguchi R., Hamano M., Iwata M., Nakamura T., Oki S., Yamanishi Y.

    Bioinformatics   38 ( 10 )   2839 - 2846   2022.05

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)

    DOI: 10.1093/bioinformatics/btac209

    Scopus

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  • Epigenetic landscape of drug responses revealed through large-scale ChIP-seq data analyses Reviewed International journal

    Zou Z., Iwata M., Yamanishi Y., Oki S.

    BMC Bioinformatics   23 ( 1 )   2022.01

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)

    DOI: 10.1186/s12859-022-04571-8

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  • The novel driver gene ASAP2 is a potential druggable target in pancreatic cancer Reviewed International journal

    Fujii A., Masuda T., Iwata M., Tobo T., Wakiyama H., Koike K., Kosai K., Nakano T., Kuramitsu S., Kitagawa A., Sato K., Kouyama Y., Shimizu D., Matsumoto Y., Utsunomiya T., Ohtsuka T., Yamanishi Y., Nakamura M., Mimori K.

    Cancer Science   112 ( 4 )   1655 - 1668   2021.04

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)

    DOI: 10.1111/cas.14858

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  • Omics-based identification of glycan structures as biomarkers for a variety of diseases Reviewed International journal

    Akiyoshi S., Iwata M., Berenger F., Yamanishi Y.

    Molecular Informatics   39 ( 1-2 )   2020.01

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)

    DOI: 10.1002/minf.201900112

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  • Network-based characterization of disease-disease relationships in terms of drugs and therapeutic targets Reviewed International journal

    Iida M., Iwata M., Yamanishi Y.

    Bioinformatics   36   I516 - I524   2020.01

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)

    DOI: 10.1093/BIOINFORMATICS/BTAA439

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  • Predicting drug-induced transcriptome responses of a wide range of human cell lines by a novel tensor-train decomposition algorithm Reviewed International journal

    Iwata M., Yuan L., Zhao Q., Tabei Y., Berenger F., Sawada R., Akiyoshi S., Hamano M., Yamanishi Y.

    Bioinformatics   35 ( 14 )   i191 - i199   2019.07

     More details

    Authorship:Lead author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)

    DOI: 10.1093/bioinformatics/btz313

    Scopus

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  • KampoDB, database of predicted targets and functional annotations of natural medicines Reviewed International journal

    Sawada R., Iwata M., Umezaki M., Usui Y., Kobayashi T., Kubono T., Hayashi S., Kadowaki M., Yamanishi Y.

    Scientific Reports   8 ( 1 )   2018.12

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)

    DOI: 10.1038/s41598-018-29516-1

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  • Predicting inhibitory and activatory drug targets by chemically and genetically perturbed transcriptome signatures Reviewed International journal

    Sawada R., Iwata M., Tabei Y., Yamato H., Yamanishi Y.

    Scientific Reports   8 ( 1 )   2018.12

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)

    DOI: 10.1038/s41598-017-18315-9

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  • Pathway-based drug repositioning for cancers: computational prediction and experimental validation Reviewed International journal

    Iwata M., Hirose L., Kohara H., Liao J., Sawada R., Akiyoshi S., Tani K., Yamanishi Y.

    Journal of Medicinal Chemistry   61 ( 21 )   9583 - 9595   2018.11

     More details

    Authorship:Lead author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)

    DOI: 10.1021/acs.jmedchem.8b01044

    Scopus

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  • Evaluation of an S-system root-finding method for estimating parameters in a metabolic reaction model Reviewed International journal

    Iwata M., Miyawaki-Kuwakado A., Yoshida E., Komori S., Shiraishi F.

    Mathematical Biosciences   301   21 - 31   2018.07

     More details

    Authorship:Lead author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)

    DOI: 10.1016/j.mbs.2018.01.010

    Scopus

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  • Elucidating the modes of action for bioactive compounds in a cell-specific manner by large-scale chemically-induced transcriptomics Reviewed International journal

    Iwata M., Sawada R., Iwata H., Kotera M., Yamanishi Y.

    Scientific Reports   7   2017.01

     More details

    Authorship:Lead author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)

    DOI: 10.1038/srep40164

    Scopus

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  • PENDISC: a simple method for constructing a mathematical model from time-series data of metabolite concentrations Reviewed International journal

    Sriyudthsak, K., Iwata, M., Hirai, M.Y., Shiraishi, F.

    Bulletin of Mathematical Biology   76 ( 6 )   1333 - 1351   2014.06

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)

    PubMed

  • Estimation of kinetic parameters in an S-system equation model for a metabolic reaction system using the Newton-Raphson method Reviewed International journal

    Iwata, M., Sriyudthsak, K., Hirai, M.Y., Shiraishi, F.

    Mathematical Biosciences   248   11 - 21   2014.02

     More details

    Authorship:Lead author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)

    PubMed

  • Coarse but efficient identification of metabolic pathway systems Reviewed International journal

    Iwata, M., Shiraishi, F., Voit, E.O.

    International Journal of Systems Biology   4 ( 1 )   57 - 72   2013.09

     More details

    Authorship:Lead author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)

  • Highly reliable computation of dynamic sensitivities in metabolic reaction systems by a variable-step Taylor series method Reviewed International journal

    Shiraishi, F., Egashira, M., Iwata, M., Sriyudthsak, K., Hattori, K.

    Asia-Pacific Journal of Chemical Engineering   7   S32 - S38   2011.09

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)

  • Highly accurate computation of dynamic sensitivities in metabolic reaction systems by a Taylor series method Reviewed International journal

    Shiraishi, F., Egashira, M., Iwata, M.

    Mathematical Biosciences   233 ( 1 )   59 - 67   2011.09

     More details

    Authorship:Last author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)

  • A reliable Taylor series-based computational method for the calculation of dynamic sensitivities in large-scale metabolic reaction systems: algorithm and software evaluation Reviewed International journal

    Shiraishi, F., Tomita, T., Iwata, M., Berrada, A.A., Hirayama, H.

    Mathematical Biosciences   222 ( 2 )   73 - 85   2009.12

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)

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Publications (Books)

Conference Prsentations (Oral, Poster)

  • 特異構造を有する化合物の生物応答理解を指向したトランスクリプトーム解析 Invited

    海東和麻, 岩田通夫, 平野圭一, 内山真伸, 山西芳裕

    日本薬学会 第143年会 

     More details

    Event date: 2023.03.25 - 2023.03.28   Language:Japanese  

  • ダイレクトリプログラミングを誘導する低分子化合物の組み合わせのin silico予測

    濱野桃子, 中村透, 岩田通夫, 江口凌平, 竹下潤一, 山西芳裕

    第22回日本再生医療学会 

     More details

    Event date: 2023.03.23 - 2023.03.25   Language:Japanese  

  • Single cell-specific drug activities are revealed by pathway trajectory analysis with tensor imputation Invited

    Iwata, M.

    JSPS-INSERM 

     More details

    Event date: 2022.12.03 - 2022.12.04   Language:English  

  • パイオニア転写因子を考慮したトランスオミクスアプローチによるデータ駆動型ダイレクトリプログラミング

    濱野桃子, 江口凌平, 岩田通夫, 中村透,沖真弥, 山西芳裕

    第45回日本分子生物学会年会 

     More details

    Event date: 2022.11.30 - 2022.12.02   Language:Japanese  

  • オミックスデータに基づく薬物の標的分子予測とケミカル空間との相関解析

    関谷拓海, 岩田通夫, 亀淵由乃, 石原慎也, 山西芳裕

    第45回ケモインフォマティクス討論会 

     More details

    Event date: 2022.11.18 - 2022.11.19   Language:Japanese  

  • Developing a network-based combination therapy approach for complex diseases

    Midori Iida, Yurika Kuniki, Kenta Yagi, Mitsuhiro Goda, Satoko Namba, Jun-ichi Takeshita, Ryusuke Sawada, Michio Iwata, Yoshito Zamami, Keisuke Ishizawa, Yoshihiro Yamanishi

    情報計算化学生物学会(CBI学会)2022年大会 

     More details

    Event date: 2022.10.25 - 2022.10.27   Language:Japanese  

  • Computational prediction of time-course drug transcriptomic responses

    Iwata, M., Yamanishi, Y.

    21st European Conference on Computational Biology (ECCB2022) 

     More details

    Event date: 2022.09.18 - 2022.09.21   Language:Japanese  

  • Small compound-based direct cell conversion with combinatorial optimization of pathway regulations

    Nakamura, T., Iwata, M., Hamano, M., Eguchi, R., Takeshita, J., Yamanishi, Y.

    21st European Conference on Computational Biology (ECCB2022) 

     More details

    Event date: 2022.09.18 - 2022.09.21   Language:English  

  • ターゲットリポジショニング:遺伝子摂動応答トランスクリプトームを用いた治療標的予測

    難波里子、岩田通夫、山西芳裕

    第11回生命医薬情報学連合大会 

     More details

    Event date: 2022.09.13 - 2022.09.15   Language:Japanese  

  • TRANSDIRE:パイオニア転写因子を考慮したトランスオミクス手法によるデータ駆動型ダイレクトリプログラミング

    濱野桃子, 江口凌平, 岩田通夫, 中村透, 沖真弥, 山西芳裕

    第11回生命医薬情報学連合大会 

     More details

    Event date: 2022.09.13 - 2022.09.15   Language:Japanese  

  • From drug repositioning to target repositioning: prediction of therapeutic targets using genetically perturbed transcriptomic signatures

    Namba, S., Iwata, M., Yamanishi, Y.

    The 30th International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2022) 

     More details

    Event date: 2022.07.10 - 2022.07.14   Language:English  

  • Simulation-guided elucidation of dynamic drug responses of the cellular systems

    Iwata, M., Yamanishi, Y.

    The 8th Strasbourg Summer School in Chemoinformatics (CS3-2022) 

     More details

    Event date: 2022.06.27 - 2022.07.01   Language:Japanese  

  • トランスオミクス解析によるダイレクトリプログラミング誘導転写因子の予測

    濱野桃子, 江口凌平, 岩田通夫, 中村透, 山西芳裕

    第21回日本再生医療学会総会 

     More details

    Event date: 2022.03.17 - 2022.03.19   Language:Japanese  

  • 化合物応答トランスクリプトーム解析によるダイレクトリプログラミングを誘導する低分子化合物のインシリコ予測

    濱野桃子, 中村透, 岩田通夫, 江口凌平, 山西芳裕

    第44回分子生物学会年会 

     More details

    Event date: 2021.12.01 - 2021.12.03   Language:Japanese  

  • Transcription factor binding profiling using chemically induced genes by ChIPEA

    Zou, Zhaonan, 岩田通夫, 山西芳裕, 沖真弥

    情報計算化学生物学会2021年大会 

     More details

    Event date: 2021.10.26 - 2021.10.28   Language:Japanese  

  • From drug repositioning to target repositioning: omics-based prediction of therapeutic targets for a variety of diseases

    難波里子, 岩田通夫, 山西芳裕

    情報計算化学生物学会2021年大会 

     More details

    Event date: 2021.10.26 - 2021.10.28   Language:Japanese  

  • ChIP-weighted TFEAによる薬剤摂動時の転写因子結合プロファイル

    Zou, Zhaonan, 岩田通夫, 山西芳裕, 沖真弥

    第10回生命医薬情報学連合大会 

     More details

    Event date: 2021.09.27 - 2021.09.29   Language:Japanese  

  • トランスクリプトームデータを用いたダイレクトリプログラミングを誘導する低分子化合物の組み合わせ予測

    濱野桃子, 中村透, 岩田通夫, 江口凌平, 山西芳裕

    第10回生命医薬情報学連合大会 

     More details

    Event date: 2021.09.27 - 2021.09.29   Language:Japanese  

  • ターゲットリポジショニング:遺伝子摂動応答トランスクリプトームを用いた創薬標的予測

    難波里子, 岩田通夫, 山西芳裕

    第10回生命医薬情報学連合大会 

     More details

    Event date: 2021.09.27 - 2021.09.29   Language:Japanese  

  • Predicting compound-induced single-cell transcriptomes by tensor decomposition for pathway trajectory analysis

    岩田通夫, 六峰弘晃, 中山裕介, 吹田直政, 山西芳裕

    第10回生命医薬情報学連合大会 

     More details

    Event date: 2021.09.27 - 2021.09.29   Language:Japanese  

  • 多様なヒト細胞における薬物応答トランスクリプトームの予測と創薬応用 Invited

    岩田通夫

    マルチNGSオミクスセミナー 

     More details

    Event date: 2021.07.16   Language:Japanese  

  • 遺伝子発現制御に着目した薬剤摂動トランスクリプトームと大規模ChIP-seqデータの統合解析による薬剤作用ターゲット探索

    鄒兆南, 岩田通夫, 山西芳裕, 沖真弥

    第43回日本分子生物学会年会 

     More details

    Event date: 2020.12.02 - 2020.12.04   Language:Japanese  

  • 低分子化合物のオミクス解析によるデータ駆動型ダイレクトリプログラミング

    中村透, 岩田通夫, 濱野桃子, 江口凌平, 山西芳裕

    第43回日本分子生物学会年会 

     More details

    Event date: 2020.12.02 - 2020.12.04   Language:Japanese  

  • パイオニア転写因子を考慮したデータ駆動型ダイレクトリプログラミング

    江口凌平, 濱野桃子, 岩田通夫, 中村透, 沖真弥, 山西芳裕

    第43回日本分子生物学会年会 

     More details

    Event date: 2020.12.02 - 2020.12.04   Language:Japanese  

  • 多層オミクス解析による遺伝子発現機構のディジーゾーム解析と治療薬探索 Invited

    岩田通夫, 沖真弥, 山西芳裕

    第43回日本分子生物学会年会 

     More details

    Event date: 2020.12.02 - 2020.12.04   Language:Japanese  

  • 摂動応答トランスクリプトームを用いた創薬標的分子と治療薬の探索

    難波里子, 岩田通夫, 飯田緑, 山西芳裕

    第9回生命医薬情報学連合大会 

     More details

    Event date: 2020.09.01 - 2020.09.03   Language:Japanese  

  • Network-based characterization of disease–disease relationships in terms of drugs and therapeutic targets

    飯田緑, 岩田通夫, 山西芳裕

    第9回生命医薬情報学連合大会 

     More details

    Event date: 2020.09.01 - 2020.09.03   Language:Japanese  

  • Network-based characterization of disease–disease relationships in terms of drugs and therapeutic targets

    Iida, M., Iwata, M., Yamanishi, Y.

    The 28th International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2020) 

     More details

    Event date: 2020.07.13 - 2020.07.16   Language:English  

  • 化合物や疾患を特徴づける大規模な遺伝子発現データを用いた創薬 Invited

    岩田通夫

    第4回KBC(Kyushu Bioinformatics Community)勉強会 

     More details

    Event date: 2020.02.19   Language:Japanese  

  • 新規のTensor-train分解アルゴリズムによる、多様なヒト細胞における薬物応答トランスクリプトームの予測

    岩田通夫, Yuan, Longhao, Zhao, Qibin, 田部井靖生, Berenger, Francois, 澤田隆介, 秋好紗弥香, 濱野桃子, 山西芳裕

    第42回日本分子生物学会年会 

     More details

    Event date: 2019.12.03 - 2019.12.06   Language:Japanese  

  • Tensor-train分解アルゴリズムによる薬物応答遺伝子発現データの解析と創薬応用

    岩田通夫, Yuan, Longhao, Zhao, Qibin, 田部井靖生, 山西芳裕

    第22回情報論的学習理論ワークショップ(IBIS2019) 

     More details

    Event date: 2019.11.20 - 2019.11.23   Language:Japanese  

  • Kampo drug repositioning and compound mixture analyses using multi-task graph convolutional neural networks

    道家光宏, 澤田隆介, 岩田通夫, 坂井幸恵, 門脇真, 山西芳裕

    情報計算化学生物学会2019年大会 

     More details

    Event date: 2019.10.22 - 2019.10.24   Language:Japanese  

  • Predicting drug-induced transcriptome responses of a wide range of human cell lines by a novel tensor-train decomposition algorithm

    岩田通夫, Yuan, Longhao, Zhao, Qibin, 田部井靖生, Berenger, Francois, 澤田隆介, 秋好紗弥香, 濱野桃子, 山西芳裕

    情報計算化学生物学会2019年大会 

     More details

    Event date: 2019.10.22 - 2019.10.24   Language:Japanese  

  • Small Compound-based direct reprogramming using large-scale omics data

    中村透, 岩田通夫, 濱野桃子, 江口凌平, 山西芳裕

    情報計算化学生物学会2019年大会 

     More details

    Event date: 2019.10.22 - 2019.10.24   Language:Japanese  

  • Computational direct reprogramming by integrating genome, transcriptome and epigenome data

    江口凌平, 濱野桃子, 岩田通夫, 中村透, 沖真弥, 山西芳裕

    情報計算化学生物学会2019年大会 

     More details

    Event date: 2019.10.22 - 2019.10.24   Language:Japanese  

  • Predicting drug-induced transcriptome responses of a wide range of human cell lines by a novel tensor-train decomposition algorithm

    岩田通夫, Yuan, Longhao, Zhao, Qibin, 田部井靖生, Berenger, Francois, 澤田隆介, 秋好紗弥香, 濱野桃子, 山西芳裕

    情報計算化学生物学会2019年大会 

     More details

    Event date: 2019.10.22 - 2019.10.24   Language:Japanese  

  • 新規のTensor-train分解アルゴリズムによる、多様なヒト細胞における薬物応答トランスクリプトームの予測

    岩田通夫, Yuan, Longhao, Zhao, Qibin, 田部井靖生, Berenger, Francois, 澤田隆介, 秋好紗弥香, 濱野桃子, 山西芳裕

    第8回生命医薬情報学連合大会 

     More details

    Event date: 2019.09.09 - 2019.09.11   Language:Japanese  

  • 低分子化合物によるデータ駆動型ダイレクトリプログラミング

    中村透, 岩田通夫, 濱野桃子, 江口凌平, 山西芳裕

    第8回生命医薬情報学連合大会 

     More details

    Event date: 2019.09.09 - 2019.09.11   Language:Japanese  

  • トランスクリプトーム情報とエピゲノム情報の融合解析によるインシリコ・ダイレクトリプログラミング

    江口凌平, 濱野桃子, 岩田通夫, 中村透, 沖真弥, 山西芳裕

    第8回生命医薬情報学連合大会 

     More details

    Event date: 2019.09.09 - 2019.09.11   Language:Japanese  

  • Pathway-based drug discovery and repositioning for cancers

    Iwata, M., Hirose, L., Kohara, H., Liao, J., Sawada, R., Akiyoshi, S., Tani, K., Yamanishi, Y.

    The 27th International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology & 18th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB2019) 

     More details

    Event date: 2019.07.21 - 2019.07.25   Language:Japanese  

  • Predicting drug-induced transcriptome responses of a wide range of human cell lines by a novel tensor-train decomposition algorithm

    Iwata, M., Yuan, L., Zhao, Q., Tabei, Y., Berenger, F., Sawada, R., Akiyoshi, S., Hamano, M., Yamanishi, Y.

    The 27th International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology & 18th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB2019) 

     More details

    Event date: 2019.07.21 - 2019.07.25   Language:English  

  • 遺伝子発現機構を介したディジーゾーム解析による疾患間の関連性解析と治療薬探索

    岩田通夫, 沖真弥, 田部井靖生, 山西芳裕

    第41回分子生物学会年会 

     More details

    Event date: 2018.11.28 - 2018.11.30   Language:Japanese  

  • 漢方薬リポジショニング:ビッグデータと機械学習による漢方薬の効能予測

    澤田隆介, 岩田通夫, 梅崎雅人, 臼井義比古, 小林敏一, 窪野孝貴, 林周作, 門脇真, 山西芳裕

    第41回ケモインフォマティクス討論会 

     More details

    Event date: 2018.10.26 - 2018.10.27   Language:Japanese  

  • Tensor-train分解アルゴリズムによる薬物応答遺伝子発現データからの創薬

    岩田通夫, Yuan, Longhao, Zhao, Qibin, 田部井靖生, 山西芳裕

    第41回ケモインフォマティクス討論会 

     More details

    Event date: 2018.10.26 - 2018.10.27   Language:Japanese  

  • Kampo drug repositioning: Analysis of the mode-of-action and prediction of new indications of Kampo medicines

    澤田隆介, 岩田通夫, 梅崎雅人, 臼井義比古, 小林敏一, 窪野孝貴, 門脇真,山西芳裕

    情報計算化学生物学会2018年大会 

     More details

    Event date: 2018.10.09 - 2018.10.11   Language:Japanese  

  • 転写因子を介したディジーゾーム解析による疾患間の関連性理解と創薬応用

    岩田通夫, 沖真弥, 田部井靖生, 山西芳裕

    第7回生命医薬情報学連合大会 

     More details

    Event date: 2018.09.19 - 2018.09.21   Language:Japanese  

  • Tensor-train分解アルゴリズムによる高次テンソル解析:薬物応答遺伝子発現データからの創薬

    岩田通夫, Yuan, Longhao, Zhao, Qibin, 田部井靖生, 山西芳裕

    2018年度統計関連学会連合大会 

     More details

    Event date: 2018.09.09 - 2018.09.13   Language:Japanese  

  • Tensor-train分解アルゴリズムによる高次テンソルデータ解析:薬物応答遺伝子発現データへの応用

    岩田通夫, Yuan, Longhao, Zhao, Qibin, 田部井靖生, 山西芳裕

    日本計算機統計学会第32回大会 

     More details

    Event date: 2018.05.26 - 2018.05.27   Language:Japanese  

  • Compuational analysis of the mode-of-action and pharmacological effects of Japanese Kampo medicines

    Sawada, R., Iwata, M., Umezaki, M., Usui, Y., Kubono, T., Kadowaki, M., Yamanishi, Y.

    The Sixteenth Asia Pacific Bioinformatics Conference (APBC2018) 

     More details

    Event date: 2018.01.15 - 2018.01.17   Language:Japanese  

  • KampoDB: An integrated platform for mode-of-action analysis and repositioning of natural medicines

    澤田隆介, 岩田通夫, 梅崎雅人, 臼井義比古, 窪野孝貴, 門脇真,山西芳裕

    情報計算化学生物学会2017年大会 

     More details

    Event date: 2017.10.03 - 2017.10.05   Language:Japanese  

  • Large-scale diseasome analysis of gene expression signatures toward understanding disease–disease associations and drug discovery

    岩田通夫, 澤田隆介, 田部井靖生, 山西芳裕

    情報計算化学生物学会2017年大会 

     More details

    Event date: 2017.10.03 - 2017.10.05   Language:Japanese  

  • 遺伝子発現プロファイルのディジーゾーム解析による疾患間の関連性理解と創薬応用

    岩田通夫, 山西芳裕

    情報計算化学生物学会2017年大会 

     More details

    Event date: 2017.10.03 - 2017.10.05   Language:Japanese  

  • 遺伝子発現プロファイルのディジーゾーム解析による疾患間の関連性理解と創薬への応用

    岩田通夫, 澤田隆介, 田部井靖生,山西芳裕

    第6回生命医薬情報学連合大会 

     More details

    Event date: 2017.09.27 - 2017.09.29   Language:Japanese  

  • 遺伝子発現プロファイルのディジーゾーム解析による疾患間の関連性理解と創薬応用

    岩田通夫, 澤田隆介, 田部井靖生, 山西芳裕

    第6回生命医薬情報学連合大会 

     More details

    Event date: 2017.09.27 - 2017.09.29   Language:Japanese  

  • Transomics-based drug repositioning for a wide range of diseases

    Sawada, R., Iwata, M., Yamanishi, Y.

    The 26th Hot Spring Harbor International Symposium 

     More details

    Event date: 2016.11.02 - 2016.11.03   Language:English  

  • Pathway-based drug discovery and repositioning by large-scale chemically-induced transcriptomics

    岩田通夫, 澤田隆介, 小寺正明,山西芳裕

    情報計算化学生物学会2016年大会 

     More details

    Event date: 2016.10.25 - 2016.10.27   Language:Japanese  

  • Predicting inhibitory and activatory effects of drug candidate compounds from chemically-induced transcriptome data by a multitask learning with gene perturbation similarity

    澤田隆介, 岩田通夫, 田部井靖生, 山西芳裕

    情報計算化学生物学会2016年大会 

     More details

    Event date: 2016.10.25 - 2016.10.27   Language:Japanese  

  • Predicting inhibitory and activatory effects of drug candidate compounds from chemically-induced transcriptome data by a multitask learning with gene perturbation similarity

    澤田隆介, 岩田通夫, 田部井靖生, 山西芳裕

    情報計算化学生物学会2016年大会 

     More details

    Event date: 2016.10.25 - 2016.10.27   Language:Japanese  

  • 遺伝子摂動類似性に基づくマルチタスク学習と化合物応答トランスクリプトーム解析による医薬品候補化合物の阻害・活性化作用の予測

    澤田隆介, 岩田通夫, 田部井靖生, 山西芳裕

    第5回生命医薬情報学連合大会 

     More details

    Event date: 2016.09.29 - 2016.10.01   Language:Japanese  

  • パスウェイ情報と化合物応答トランスクリプトーム解析によるドラッグリポジショニング:計算機的予測と実験的検証

    岩田通夫, 澤田隆介, 小寺正明,山西芳裕

    第5回生命医薬情報学連合大会 

     More details

    Event date: 2016.09.29 - 2016.10.01   Language:Japanese  

  • 遺伝子摂動類似性に基づくマルチタスク学習と化合物応答トランスクリプトーム解析による医薬品候補化合物の阻害・活性化作用の予測

    澤田隆介, 岩田通夫, 田部井靖生, 山西芳裕

    第5回生命医薬情報学連合大会 

     More details

    Event date: 2016.09.29 - 2016.10.01   Language:Japanese  

  • パスウェイ情報と化合物応答トランスクリプトーム解析によるドラッグリポジショニング:計算機的予測と実験的検証

    岩田通夫, 澤田隆介, 小寺正明, 山西芳裕

    第5回生命医薬情報学連合大会 

     More details

    Event date: 2016.09.29 - 2016.10.01   Language:Japanese  

  • 薬物の標的タンパク質プロファイルとオミックス情報に基づくドラッグリポジショニング

    澤田隆介, 岩田通夫, 山西芳裕

    第38回分子生物学会・第88回生化学会合同大会 

     More details

    Event date: 2015.12.01 - 2015.12.04   Language:Japanese  

  • 化合物応答遺伝子発現プロファイルの大規模解析による生理活性化合物の作用機序推定と創薬への応用

    岩田通夫, 澤田隆介, 山西芳裕

    第38回分子生物学会・第88回生化学会合同大会 

     More details

    Event date: 2015.12.01 - 2015.12.04   Language:Japanese  

  • 化合物応答遺伝子発現プロファイルの大規模解析による生理活性化合物の作用機序推定と創薬への応用

    岩田通夫, 澤田隆介, 山西芳裕

    第38回分子生物学会・第88回生化学会合同大会 

     More details

    Event date: 2015.12.01 - 2015.12.04   Language:Japanese  

  • 化合物応答遺伝子発現プロファイルの大規模解析による生理活性化合物の作用機序の推定

    岩田通夫, 澤田隆介, 山西芳裕

    第4回生命医薬情報学連合大会 

     More details

    Event date: 2015.10.29 - 2015.10.31   Language:Japanese  

  • 化合物摂動と遺伝子摂動の遺伝子発現プロファイルを用いた医薬品候補化合物の標的タンパク質予測

    澤田隆介, 岩田通夫, 山西芳裕

    第4回生命医薬情報学連合大会 

     More details

    Event date: 2015.10.29 - 2015.10.31   Language:Japanese  

  • 化合物摂動と遺伝子摂動の遺伝子発現プロファイルを用いた医薬品候補化合物の標的タンパク質予測

    澤田隆介, 岩田通夫, 山西芳裕

    第4回生命医薬情報学連合大会 

     More details

    Event date: 2015.10.29 - 2015.10.31   Language:Japanese  

  • 化合物応答遺伝子発現プロファイルの大規模解析による生理活性化合物の作用機序の推定

    岩田通夫, 澤田隆介, 山西芳裕

    情報計算化学生物学会2015年大会 

     More details

    Event date: 2015.10.27 - 2015.10.29   Language:Japanese  

  • 化合物・タンパク質間インターラクトーム情報とオミックスデータに基づくドラッグリポジショニング

    澤田隆介, 岩田通夫, 山西芳裕

    情報計算化学生物学会2015年大会 

     More details

    Event date: 2015.10.27 - 2015.10.29   Language:Japanese  

  • Evaluation of computational methods for predicting drug efficacy and targets from drug-induced gene expression data in Cmap

    Iwata, M., Sawada, R., Iwata, H., Yamanishi, Y.

    International Symposium on Synthetic Systems Biology: Synthetic Metabolic Pathway, Mathematical System Analysis and Design of Bio-inspired System; Joint 14th Symposium of Biochemical Systems Theory (BST2015) 

     More details

    Event date: 2015.09.17 - 2015.09.18   Language:Japanese  

  • Coarse but efficient identification of metabolic pathway systems

    Iwata, M., Shiraishi, F., Voit, E.O.

    International Symposium on Synthetic Systems Biology: Synthetic Metabolic Pathway, Mathematical System Analysis and Design of Bio-inspired System; Joint 14th Symposium of Biochemical Systems Theory (BST2015) 

     More details

    Event date: 2015.09.17 - 2015.09.18   Language:English  

  • Evaluation of computational methods for predicting drug efficacy and targets from drug-induced gene expression data in Cmap

    Iwata, M., Sawada, R., Iwata, H., Yamanishi, Y.

    The 26th International Conference on Genome Informatics & The 14th International Conference on Bioinformatics (GIW/InCoB2015) 

     More details

    Event date: 2015.09.09 - 2015.09.11   Language:Japanese  

  • 薬物の標的分子予測に向けたミッシング酵素のオミックスデータ解析

    岩田通夫, 小寺正明, 山西芳裕

    第3回生命医薬情報学連合大会 

     More details

    Event date: 2014.10.02 - 2014.10.04   Language:Japanese  

  • S-システム型式を用いて大胆かつ効率よく代謝システムを数式化する方法の検討

    岩田通夫, 白石文秀, Voit, Eberhard O.

    化学工学会第45回秋季大会 

     More details

    Event date: 2013.09.16 - 2013.09.18   Language:Japanese  

  • A strategy for systematic parameter estimation in large-scale metabolic reaction networks

    Iwata, M., Shiraishi, F.

    Frontiers in systems and synthetic biology’13 

     More details

    Event date: 2013.03.20 - 2013.03.24   Language:Japanese  

  • 代謝反応システムに対するS-システム型モデル式中の速度パラメータ推算におけるNewton-Raphson法の性能

    岩田通夫, Sriyudthsak, Kansuporn, 平井優美, 白石文秀

    平成24年度農芸化学会西日本支部および日本栄養・食糧学会九州・沖縄支部合同大会 

     More details

    Event date: 2012.09.27 - 2012.09.29   Language:Japanese  

  • 代謝反応システムにおける数式モデルの構築と速度パラメータの迅速推算

    岩田通夫, 白石文秀

    化学工学会第44回秋季大会 

     More details

    Event date: 2012.09.19 - 2012.09.21   Language:Japanese  

  • Rapid estimation of kinetic parameters in S-system type differential equation models for metabolic reaction networks

    Iwata, M., Shiraishi, F.

    14th Asia Pacific Confederation of Chemical Engineering Congress 

     More details

    Event date: 2012.02.22 - 2012.02.24   Language:English  

  • 代謝反応ネットワークに対するS-システム型モデル中の速度パラメータ推算

    岩田通夫, Sriyudthsak, Kansuporn, 平井優美, 白石文秀

    化学工学会第43回秋季大会 

     More details

    Event date: 2011.09.14 - 2011.09.16   Language:Japanese  

  • 動的感度ソフトSoftCADSの開発とその性能評価

    白石文秀, 江頭正朗, 岩田通夫

    2011生態工学会年次大会 

     More details

    Event date: 2011.06.15 - 2011.06.16   Language:Japanese  

  • Algorithm of Newton-Raphson method for parameter estimation of decoupled S-systems

    Iwata, M., Shiraishi, F.

    The XII International Congress on Molecular Systems Biology 

     More details

    Event date: 2011.05.08 - 2011.05.12   Language:Japanese  

  • Parameter estimation of decoupled S-systems by Newton-Raphson method

    Shiraishi, F., Iwata, M., Sriyudthsak, K., Hirai, M.H., Naito, S.

    The XII International Congress on Molecular Systems Biology 

     More details

    Event date: 2011.05.08 - 2011.05.12   Language:English  

  • A highly reliable computation of dynamic sensitivities in metabolic reaction systems by a Taylor series method

    Shiraishi, F., Iwata, M., Egashira, M., Sriyudthsak, K., Hattori, K.

    The 13th Asia Pacific Confederation of Chemical Engineering Congress 

     More details

    Event date: 2010.10.05 - 2010.10.08   Language:English  

  • Taylor級数法によれば硬い微分方程式でも超高精度の数値解が得られる

    岩田通夫, 江頭正朗, 白石文秀

    化学工学会第42回秋季大会 

     More details

    Event date: 2010.09.06 - 2010.09.08   Language:Japanese  

  • 極低濃度域における有機化合物の光触媒分解に対する反応速度解析と問題点

    岩田通夫, 白石文秀, 宮川洋光

    化学工学会第41回秋季大会 

     More details

    Event date: 2009.09.16 - 2009.09.18   Language:Japanese  

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Press

  • 九州工大、1細胞レベルで薬効解析 精密医療の安全性向上   Newspaper, magazine

    山西芳裕, 岩田通夫

    日本経済新聞社  日刊工業新聞  2022.12.06

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    Author:Other  

Honors and Awards

  • 優秀口頭発表賞

    日本バイオインフォマティクス学会   2021.09.29

    岩田通夫, 六峰弘晃, 中山裕介, 吹田直政, 山西芳裕

     More details

    Country:Japan

  • ポスター賞

    情報計算化学生物学会   2017.10.01

    岩田通夫, 澤田隆介, 田部井靖生, 山西芳裕

     More details

    Country:Japan

  • 最優秀口頭発表賞

    日本バイオインフォマティクス学会   2017.09.29

    岩田通夫, 澤田隆介, 田部井靖生, 山西芳裕

     More details

    Country:Japan

  • 研究奨励賞

    日本バイオインフォマティクス学会   2016.10.01

    岩田通夫, 澤田隆介, 小寺正明, 山西芳裕

     More details

    Country:Japan

  • 研究奨励賞

    日本バイオインフォマティクス学会   2015.10.31

    澤田隆介, 岩田通夫, 山西芳裕

     More details

    Country:Japan

  • ポスター賞

    日本バイオインフォマティクス学会   2014.10.04

    岩田通夫, 小寺正明, 山西芳裕

     More details

    Country:Japan

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Grants-in-Aid for Scientific Research

  • 大規模代謝反応システムにおけるメタボロミクスデータからの数式モデル構築法

    Grant number:12J02804  2012.04 - 2014.03   特別研究員奨励費

Activities of Academic societies and Committees

  • 情報計算化学生物学会2023年大会 プログラム委員会   委員