2026/08/18 更新

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セイケ　タイスケ
清家　泰介
SEIKE Taisuke
Scopus 論文情報
総論文数: 32 総Citation: 260 h-index: 10

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所属
大学院情報工学研究院 生命情報工学研究系
職名
准教授
メールアドレス
メールアドレス
研究室住所
福岡県飯塚市川津680-4
ホームページ
https://tbtsjlpmghrs.wixsite.com/saypombe
プロフィール
酵母をモデルに、有性生殖の進化や野生酵母の生態といった生命現象の仕組みを分子レベルで解明し、合成生物学の視点からバイオテクノロジーや産業利用に向けた新たな技術基盤の創出を目指して研究を行っています。
外部リンク

研究分野

  • ライフサイエンス / 多様性生物学、分類学

  • ライフサイエンス / システムゲノム科学

  • ライフサイエンス / ゲノム生物学

  • ライフサイエンス / 応用微生物学

  • ライフサイエンス / 進化生物学

出身学校

  • 2009年03月   大阪市立大学   理学部   生物学科   卒業   日本国

出身大学院

  • 2014年03月   大阪市立大学   理学研究科   生物地球系専攻   博士課程・博士後期課程   修了   日本国

  • 2011年03月   大阪市立大学   理学研究科   生物地球系専攻   修士課程・博士前期課程   修了   日本国

取得学位

  • 大阪市立大学  -  博士（理学）   2014年03月

学内職務経歴

  • 2026年04月 - 現在   九州工業大学   大学院情報工学研究院   生命情報工学研究系     准教授

  • 2026年04月 - 現在   九州工業大学   研究本部   重点プロジェクトセンター   合成生物工学研究センター     准教授

  • 2025年04月 - 2026年03月   九州工業大学   大学院情報工学研究院   生命化学情報工学研究系     准教授

学外略歴

  • 2024年10月 - 現在   国立研究開発法人   科学技術振興機構 (JST)   さきがけ研究者

  • 2024年09月 - 2026年03月   国立遺伝学研究所   遺伝形質研究系   外来研究員

  • 2021年04月 - 2025年03月   大阪大学   先導的学際研究機構   兼任教員

  • 2020年09月 - 現在   理化学研究所   生命機能科学研究センター   客員研究員

  • 2020年09月 - 2025年03月   大阪大学   大学院情報科学研究科   助教   日本国

  • 2018年04月 - 2020年08月   理化学研究所   生命機能科学研究センター   研究員   日本国

  • 2015年04月 - 2018年03月   国立遺伝学研究所   系統生物研究センター   日本学術振興会特別研究員   日本国

  • 2014年04月 - 2015年03月   産業技術総合研究所   生物プロセス研究部門   研究員   日本国

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所属学会・委員会

  • 2024年04月 - 現在   日本微生物生態学会   日本国

  • 2021年04月 - 現在   日本生物工学会   日本国

  • 2021年03月 - 現在   日本農芸化学会   日本国

  • 2012年01月 - 現在   日本ゲノム微生物学会   日本国

  • 2008年04月 - 現在   酵母遺伝学フォーラム   日本国

論文

  • Metschnikowia okinawaensis sp. nov. and Metschnikowia ryukyuensis sp. nov., two novel yeast species isolated from flowers and young fruits in Okinawa, Japan. 査読有り 国際誌

    Yamamoto M, Takekata H, Sakata N, Kotani H, Furusawa C, Matsuda F, Seike T

    Mycoscience   in press   2026年08月

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    担当区分：最終著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）

  • Context-dependent activation and evolutionary buffering of a mating pheromone in fission yeast. 査読有り 国際誌

    Seike T, Sakata N, Kotani H, Furusawa C

    Communications Biology   9   534   2026年04月

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    担当区分：筆頭著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）

    DOI： 10.1038/s42003-026-10058-6

  • Phenotypic diversity of yeasts curated in the 5th edition of The Yeasts : A data-driven visualization approach. 国際誌

    Seike T, Ide M, Yamamoto M, Yurimoto H, Shiraishi K

    bioRxiv   2026年02月

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    担当区分：筆頭著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）

    DOI： 10.64898/2026.02.15.706042

  • Constitutive sporulation in wild fission yeast enhances insect-mediated survival. 国際誌

    Niki H, Noda S, Fujiwara K, Miyake T, Akiyama K, Seike T

    bioRxiv   2026年01月

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    担当区分：最終著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）

    DOI： 10.64898/2026.01.14.699589

  • Exploration of yeast species suitable for preparation of stable isotope-labeled internal standards extracts (SILIS). 査読有り 国際誌

    Seike T, Kahar P, Ogino C, Matsuda F

    Mass Spectrometry   14 ( 1 )   A0177   2025年10月

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    担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）

    DOI： 10.5702/massspectrometry.A0177

  • Discovery and identification of a novel yeast species, Hanseniaspora drosophilae sp. nov., from Drosophila in Okinawa, Japan. 査読有り 国際誌

    Seike T, Takekata H, Kono K, Sakata N, Kotani H, Furusawa C, Matsuda F

    International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology   75 ( 2 )   006661   2025年02月

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    担当区分：筆頭著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）

    DOI： 10.1099/ijsem.0.006661

    Kyutacar

  • Yamadazyma thunbergiae sp. nov., a novel yeast species associated with Bengal clock vines and soil in Okinawa, Japan. 査読有り 国際誌

    Seike T, Takekata H, Sakata N, Furusawa C, Matsuda F

    International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology   74 ( 10 )   006537   2024年10月

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    担当区分：筆頭著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）

    DOI： 10.1099/ijsem.0.006537

  • Improvement of ethanol and 2,3-butanediol production in Saccharomyces cerevisiae by ATP wasting. 査読有り 国際誌

    #Yatabe F, #Seike T, Okahashi N, Ishii J, Matsuda F

    Microbial Cell Factories   22 ( 1 )   204   2023年10月

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    担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）

    DOI： 10.1186/s12934-023-02221-z

  • Wickerhamiella bidentis sp. nov., a novel yeast species isolated from flowers and insects in Japan. 査読有り 国際誌

    Seike T, Takekata H, Uchida Y, Sakata N, Furusawa C, Matsuda F

    International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology   73 ( 3 )   005739   2023年03月

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    担当区分：筆頭著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）

    DOI： 10.1099/ijsem.0.005739

  • Pheromone response and mating behavior in fission yeast. 招待有り 査読有り 国際誌

    Seike T, Niki HH.

    Microbiology and Molecular Biology Reviews   86 ( 4 )   e0013022   2022年12月

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    担当区分：筆頭著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）

    DOI： 10.1128/mmbr.00130-22

  • The sixth transmembrane region of a pheromone G-protein coupled receptor, Map3, is implicated in discrimination of closely related pheromones in Schizosaccharomyces pombe. 査読有り 国際誌

    Seike T, Sakata N, Shimoda C, Niki H, Furusawa C

    Genetics   219 ( 4 )   iyab150   2021年09月

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    担当区分：筆頭著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）

    DOI： 10.1093/genetics/iyab150

  • Random transfer of Ogataea polymorpha genes into Saccharomyces cerevisiae reveals a complex background of heat tolerance. 査読有り 国際誌

    Seike T, Narazaki Y, Kaneko Y, Shimizu H, Matsuda F

    Journal of Fungi   7 ( 4 )   302   2021年04月

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    担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）

    DOI： 10.3390/jof7040302

  • Elevated sporulation efficiency in fission yeast Schizosaccharomyces japonicus strains isolated from Drosophila. 査読有り 国際誌

    Seike T, Sakata N, Matsuda F, Furusawa C

    Journal of Fungi   7 ( 5 )   350   2021年04月

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    担当区分：筆頭著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）

    DOI： 10.3390/jof7050350

    Kyutacar

  • The asymmetric chemical structures of two mating pheromones reflect their differential roles in mating of fission yeast. 査読有り 国際誌

    Seike T, Maekawa H, Nakamura T, Shimoda C

    Journal of Cell Science   132 ( 12 )   jcs230722   2019年06月

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    担当区分：筆頭著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）

    DOI： 10.1242/jcs.230722

  • Molecular evolutionary engineering of xylose isomerase to improve its catalytic activity and performance of micro-aerobic glucose/xylose co-fermentation in Saccharomyces cerevisiae. 査読有り 国際誌

    Seike T, Kobayashi Y, Sahara T, Ohgiya S, Kamagata Y, Fujimori KE

    Biotechnology for Biofuels   12 ( 1 )   139   2019年06月

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    担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）

    DOI： 10.1186/s13068-019-1474-z

  • The evolution of peptide mating pheromones in fission yeast. 招待有り 査読有り 国際誌

    Seike T

    Current Genetics   65 ( 5 )   1107 - 1111   2019年04月

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    担当区分：筆頭著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）

    DOI： 10.1007/s00294-019-00968-w

  • Role of pheromone recognition systems in creating new species of fission yeast. 招待有り 査読有り 国際誌

    Seike T, Shimoda C

    Microbial Cell   6 ( 4 )   209 - 211   2019年03月

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    担当区分：筆頭著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）

    DOI： 10.15698/mic2019.04.675

  • Asymmetric diversification of mating pheromones in fission yeast. 査読有り 国際誌

    Seike T, Shimoda C, Niki H

    PLoS Biology   17 ( 1 )   e3000101   2019年01月

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    担当区分：筆頭著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）

    DOI： 10.1371/journal.pbio.3000101

  • Mating response and construction of heterothallic strains of the fission yeast Schizosaccharomyces octosporus. 査読有り 国際誌

    Seike T, Niki H

    FEMS Yeast Research   17 ( 5 )   fox045   2017年08月

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    担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）

    DOI： 10.1093/femsyr/fox045

  • Molecular coevolution of a sex pheromone and its receptor triggers reproductive isolation in Schizosaccharomyces pombe. 査読有り 国際誌

    Seike T, Nakamura T, Shimoda C

    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America   112 ( 14 )   4405 - 4410   2015年04月

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    担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）

    DOI： 10.1073/pnas.1501661112

  • Distal and proximal actions of peptide pheromone M-factor control different conjugation steps in fission yeast. 査読有り 国際誌

    Seike T, Nakamura T, Shimoda C

    PLoS ONE   8 ( 7 )   e69491   2013年07月

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    担当区分：筆頭著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）

    2013年07月

    DOI： 10.1371/journal.pone.0069491

  • Remarkably simple sequence requirement of the M-factor pheromone of Schizosaccharomyces pombe. 査読有り 国際誌

    Seike T, Yamagishi Y, Iio H, Nakamura T, Shimoda C

    Genetics   191 ( 3 )   815 - 825   2012年07月

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    担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）

    DOI： 10.1534/genetics.112.140483

  • Metabolic bottleneck at TCA cycle entry point and competition with trehalose production hinder growth of methylotrophic yeasts during methanol assimilation. 査読有り 国際誌

    Kamiyama A, Seike T, Okahashi N, Kahar P, Ogino C, Matsuda F

    Journal of Bioscience and Bioengineering   142 ( 1 )   52 - 60   2026年04月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）

    DOI： 10.1016/j.jbiosc.2026.03.003

  • Locus heterogeneity in the mechanism underlying the superior fermentation performances of phylogenetically distant sake yeasts. 査読有り 国際誌

    Mori K, Seike T, Akao T, Takao Y, Yamada T, Takahashi T, Matsuda F

    Journal of Bioscience and Bioengineering   140 ( 5 )   306 - 313   2025年11月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）

    DOI： 10.1016/j.jbiosc.2025.08.005

  • Comparative metabolome analysis of sake yeast with enhanced fermentation performance in sake fermentation conditions. 査読有り 国際誌

    Mori K, Seike T, Okahashi N, Takahashi T, Matsuda F

    Journal of Bioscience and Bioengineering   140 ( 1 )   28 - 35   2025年07月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）

    DOI： 10.1016/j.jbiosc.2025.04.001

  • ATP supply from cytosol to mitochondria is an additional role of aerobic glycolysis to prevent programmed cell death by maintenance of mitochondrial membrane potential. 査読有り 国際誌

    Sawai A, Taniguchi T, Noguchi K, Seike T, Okahashi N, Takaine M, Matsuda F

    Metabolites   15 ( 7 )   461   2025年07月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）

    DOI： 10.3390/metabo15070461

  • Data-independent acquisition-based lipidomics reveals lipidome alterations associated with growth of Saccharomyces cerevisiae at low temperature. 査読有り 国際誌

    Hara D, Okahashi N, Seike T, Iida J, Matsuda F

    Journal of Bioscience and Bioengineering   139 ( 6 )   414 - 423   2025年06月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）

    DOI： 10.1016/j.jbiosc.2025.03.004

  • ΔΔG method for elucidating key control reactions from relative quantification metabolome data: Comparative analysis of yeast glycolysis. 査読有り 国際誌

    Matsuda F, Kamiyama A, Yamasaki K, Seike T, Okahashi N

    Analytical Chemistry   97 ( 12 )   6391 - 6398   2025年04月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）

    DOI： 10.1021/acs.analchem.4c04480

  • 13C-metabolic flux analysis of Saccharomyces cerevisiae in complex media. 査読有り 国際誌

    Fujiwara H, Okahashi N, Seike T, Matsuda F

    Metabolic Engineering Communications   20   e00260   2025年04月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）

    DOI： 10.1016/j.mec.2025.e00260

    Kyutacar

  • Metabolome analysis of metabolic burden in Escherichia coli caused by overexpression of green fluorescent protein and delta-rhodopsin. 査読有り 国際誌

    Matsuyama C, Seike T, Okahashi N, Niide T, Hara KY, Hirono-Hara Y, Ishii J, Shimizu H, Toya Y, Matsuda F

    Journal of Bioscience and Bioengineering   137 ( 3 )   187 - 194   2024年03月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）

    DOI： 10.1016/j.jbiosc.2023.12.003

  • Improved 2,3-butanediol production rate of metabolically engineered Saccharomyces cerevisiae by deletion of RIM15 and activation of pyruvate consumption pathway. 査読有り 国際誌

    Sugimura M, Seike T, Okahashi N, Izumi Y, Bamba T, Ishii J, Matsuda F

    International Journal of Molecular Sciences   24 ( 22 )   16378   2023年11月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）

    DOI： 10.3390/ijms242216378

  • Evolutionary approach for improved proton pumping activity of heterologous rhodopsin expressed in Escherichia coli. 査読有り 国際誌

    Otsuka K, Seike T, Toya Y, Ishii J, Hirono-Hara Y, Hara KY, Matsuda F

    Journal of Bioscience and Bioengineering   134 ( 6 )   484 - 490   2022年12月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）

    DOI： 10.1016/j.jbiosc.2022.08.006

  • Improvement of 2,3-butanediol production by dCas9 gene expression system in Saccharomyces cerevisiae. 査読有り 国際誌

    Morita K, Seike T, Ishii J, Matsuda F, Shimizu H

    Journal of Bioscience and Bioengineering   133 ( 3 )   208 - 212   2022年03月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）

    DOI： 10.1016/j.jbiosc.2021.12.007

  • Comparative 13C-metabolic flux analysis indicates elevation of ATP regeneration, carbon dioxide, and heat production in industrial Saccharomyces cerevisiae strains. 査読有り 国際誌

    Yatabe F, Okahashi N, Seike T, Matsuda F

    Biotechnology Journal   13 ( 3 )   2021年05月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）

    DOI： 10.1002/biot.202000438

  • Whole-genome sequence of an isogenic haploid strain, saccharomyces cerevisiae IR-2idA30(MATa), established from the industrial diploid strain IR-2. 査読有り 国際誌

    Fujimori KE, Kobayashi Y, Seike T, Sahara T, Ohgiya S, Kamagata Y

    Microbiology Resource Announcements   8 ( 17 )   e00018 - e00019   2019年04月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）

    DOI： 10.1128/MRA.00018-19

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