研究者詳細 - 青木　俊介

アオキ　シュンスケ

青木　俊介

AOKI Shunsuke

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Citation Countは当該年に発表した論文の被引用数

所属

大学院情報工学研究院生命化学情報工学研究系

職名

教授

外部リンク

研究キーワード

幹細胞
in silico 薬剤設計
タンパク質構造
神経再生
神経工学

研究分野

ライフサイエンス / 神経科学一般
ライフサイエンス / 細胞生物学
情報通信 / 生命、健康、医療情報学

取得学位

大阪大学 - 博士 1998年03月

学内職務経歴

2023年04月 - 2024年03月九州工業大学大学院情報工学研究院学際情報工学専攻長
2023年04月 - 2024年03月九州工業大学大学院情報工学研究院生命化学情報工学研究系生命化学情報工学研究系長
2023年04月 - 2024年03月九州工業大学大学院情報工学研究院生命化学情報工学研究系生命化学情報工学科長
2020年04月 - 現在九州工業大学副理事（入試担当）
2019年04月 - 現在九州工業大学大学院情報工学研究院生命化学情報工学研究系教授
2018年04月 - 2020年03月九州工業大学大学院情報工学研究院副情報工学研究院長
2015年07月 - 2019年03月九州工業大学大学院情報工学研究院生命情報工学研究系教授
2008年04月 - 2015年06月九州工業大学大学院情報工学研究院生命情報工学研究系准教授

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論文

Identification of Novel Antimicrobial Compounds Targeting Mycobacterium tuberculosis S-Adenosyl-L-Homocysteine Hydrolase Using Dual Hierarchical In Silico Structure-Based Drug Screening 査読有り国際誌

Ito H., Monobe K., Okubo S., Aoki S.

Molecules 29 ( 6 ) 2024年03月

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担当区分：最終著者,　責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

The emergence of multidrug-resistant and extensively drug-resistant Mycobacterium tuberculosis (M. tuberculosis) has become a major medical problem. S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase (MtSAHH) was selected as the target protein for the identification of novel anti-TB drugs. Dual hierarchical in silico Structure-Based Drug Screening was performed using a 3D compound structure library (with over 150 thousand synthetic chemicals) to identify compounds that bind to MtSAHH’s active site. In vitro experiments were conducted to verify whether the nine compounds selected as new drug candidates exhibited growth-inhibitory effects against mycobacteria. Eight of the nine compounds that were predicted by dual hierarchical screening showed growth-inhibitory effects against Mycobacterium smegmatis (M. smegmatis), a model organism for M. tuberculosis. Compound 7 showed the strongest antibacterial activity, with an IC50 value of 30.2 µM. Compound 7 did not inhibit the growth of Gram-negative bacteria or exert toxic effects on human cells. Molecular dynamics simulations of 40 ns using the MtSAHH–Compound 7 complex structure suggested that Compound 7 interacts stably with the MtSAHH active site. These in silico and in vitro results suggested that Compound 7 is a promising lead compound for the development of new anti-TB drugs.

DOI： 10.3390/molecules29061303

Kyutacar

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In Silico Identification of Potential Inhibitors against Staphylococcus aureus Tyrosyl-tRNA Synthetase 査読有り国際誌

Monobe K., Taniguchi H., Aoki S.

Current Computer-Aided Drug Design 20 ( 5 ) 452 - 462 2024年01月

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担当区分：最終著者,　責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

Background: Drug-resistant Staphylococcus aureus (S. aureus) has spread from noso-comial to community-acquired infections. Novel antimicrobial drugs that are effective against resistant strains should be developed.S. aureus tyrosyl-tRNA synthetase (saTyrRS) is considered essential for bacterial survival and is an attractive target for drug screening. Objectives: The purpose of this study was to identify potential new inhibitors of saTyrRS by screening compounds in silico and evaluating them using molecular dynamics (MD) simulations. Methods: A 3D structural library of 154,118 compounds was screened using the DOCK and GOLD docking simulations and short-time MD simulations. The selected compounds were sub-jected to MD simulations of a 75-ns time frame using GROMACS. Results: Thirty compounds were selected by hierarchical docking simulations. The binding of these compounds to saTyrRS was assessed by short-time MD simulations. Two compounds with an average value of less than 0.15 nm for the ligand RMSD were ultimately selected. The long-time (75 ns) MD simulation results demonstrated that two novel compounds bound stably to saT-yrRS in silico. Conclusion: Two novel potential saTyrRS inhibitors with different skeletons were identified by in silico drug screening using MD simulations. The in vitro validation of the inhibitory effect of these compounds on enzyme activity and their antibacterial effect on drug-resistant S. aureus would be useful for developing novel antibiotics.

DOI： 10.2174/1573409919666230612120819

Kyutacar

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Computational Screening and Experimental Validation of Inhibitor Targeting the Complex Formation of Grb14 and Insulin Receptor 査読有り国際誌

Ochi Y., Matsui T., Inoue K., Monobe K., Sakamoto H., Aoki S., Taira J.

Molecules 29 ( 1 ) 2024年01月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

The development of drugs targeting gene products associated with insulin resistance holds the potential to enhance our understanding of type 2 diabetes mellitus (T2DM). The virtual screening, based on a three-dimensional (3D) protein structure, is a potential technique to accelerate the development of molecular target drugs. Among the targets implicated in insulin resistance, the genetic characterization and protein function of Grb14 have been clarified without contradiction. The Grb14 gene displays significant variations in T2DM, and its gene product is known to inhibit the function of the insulin receptor (IR) by directly binding to the tyrosine kinase domain. In the present study, a virtual screening, based on a 3D structure of the IR tyrosine kinase domain (IRβ) in complex with part of Grb14, was conducted to find compounds that can disrupt the complex formation between Grb14 and IRβ. First, ten compounds were selected from 154,118 compounds via hierarchical in silico structure-based drug screening, composed of grid docking-based and genetic algorithm-based programs. The experimental validations suggested that the one compound can affect the blood glucose level. The molecular dynamics simulations and co-immunoprecipitation analysis showed that the compound did not completely suppress the protein–protein interaction between Grb14 and IR, though competitively bound to IR with the tyrosine kinase pseudosubstrate region in Grb14.

DOI： 10.3390/molecules29010198

Kyutacar

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Computer-Assisted Identification of Inhibitor with Novel Pharmacophore Targeting First Kringle Domain of Hepatocyte Growth Factor 査読有り

Taira J., Yamaguchi M., Tashiro A., Kida A., Suzuki K., Sakai K., Matsumoto K., Aoki S.

ChemistrySelect 8 ( 36 ) 2023年09月

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担当区分：責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

Hepatocyte growth factor (HGF) participates in multiple biological and pathogenic processes, such as liver regeneration, wound healing, and tumor metastasis. These biological effects are initiated by its binding to Met, so it is anticipated that compounds that can disturb the HGF-Met association could become novel modulating drugs targeting HGF and its related signaling. In this study, a chemical library composed of 154,118 compounds was screened by in silico structure-based drug screening (SBDS) techniques to obtain HGF-targeting compound. X-ray structural data of the N-terminal and first kringle domains of HGF (PDBid: 5CS9) were analyzed using the binding energy of known inhibitors and false positive inhibitors. The top five candidate compounds, identified by the DOCK-GOLD combined screening program, were subjected to cell-based ELISA assay to confirm experimentally these inhibitory activity on Met activation. The present in silico SBDS study enabled identification of compound which inhibits HGF-promoted Met phosphorylation (compound 2). The present study also suggested that Trp188/Tyr198 in HGF are essential for compound 2 binding as well as Met activation.

DOI： 10.1002/slct.202301577

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Identification of α-Tocopherol succinate as an RFFL-substrate interaction inhibitor inducing peripheral CFTR stabilization and apoptosis 査読有り

Taniguchi S., Ono Y., Doi Y., Taniguchi S., Matsuura Y., Iwasaki A., Hirata N., Fukuda R., Inoue K., Yamaguchi M., Tashiro A., Egami D., Aoki S., Kondoh Y., Honda K., Osada H., Kumeta H., Saio T., Okiyoneda T.

Biochemical Pharmacology 215 2023年09月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

The E3 ubiquitin ligase RFFL is an apoptotic inhibitor highly expressed in cancers and its knockdown suppresses cancer cell growth and sensitizes to chemotherapy. RFFL also participates in peripheral protein quality control which removes the functional cell surface ΔF508-CFTR channel and reduces the efficacy of pharmaceutical therapy for cystic fibrosis (CF). Although RFFL inhibitors have therapeutic potential for both cancer and CF, they remain undiscovered. Here, a chemical array screening has identified α-tocopherol succinate (αTOS) as an RFFL ligand. NMR analysis revealed that αTOS directly binds to RFFL's substrate-binding region without affecting the E3 enzymatic activity. Consequently, αTOS inhibits the RFFL-substrate interaction, ΔF508-CFTR ubiquitination and elimination from the plasma membrane of epithelial cells, resulting in the increased functional CFTR channel. Among the α-tocopherol (αTOL) analogs we tested, only αTOS inhibited the RFFL-substrate interaction and increased the cell surface ΔF508-CFTR, depending on RFFL expression. Similarly, the unique proapoptotic effect of αTOS was dependent on RFFL expression. Thus, unlike other αTOL analogs, αTOS acts as an RFFL protein-protein interaction inhibitor which may explain its unique biological properties among αTOL analogs. Moreover, αTOS may act as a CFTR stabilizer, a novel class of drugs that extend cell surface ΔF508-CFTR lifetime.

DOI： 10.1016/j.bcp.2023.115730

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Identification of novel antimicrobial compounds targeting Mycobacterium tuberculosis shikimate kinase using in silico hierarchical structure-based drug screening 査読有り国際誌

Kawamoto S., Hori C., Taniguchi H., Okubo S., Aoki S.

Tuberculosis 141 2023年07月

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担当区分：最終著者,　責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

The development of new anti-TB drugs to prevent the spread of multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis (Mtb) strains is imperative. Mtb shikimate kinase (MtSK) was selected as the target protein to screen for new anti-TB drugs. We performed hierarchical in silico screening using a library of 154,118 compounds to search for novel compounds that could bind to the active site of MtSK. The growth-inhibitory effects of the candidate compounds on Mycobacterium smegmatis were evaluated in vitro. Nine of the 11 candidate compounds exhibited inhibitory effects against mycobacteria in vitro. The inhibitory activity of Compound 2 (IC50 = 1.39 μM) was higher than that of isoniazid, the first-line drug for TB treatment. Moreover, Compound 2 did not exhibit toxicity against mammalian cells and Escherichia coli. Molecular dynamics simulations using the MtSK-Compound 2 complex structure in a timeframe of 100 ns suggested that Compound 2 could stably bind to MtSK. The binding free energy of Compound 2 was estimated to be −37.96 kcal/mol using the MM/PBSA method, demonstrating that Compound 2 can stably bind to MtSK. These in silico and in vitro results indicated that Compound 2 is a promising hit compound for the development of novel anti-TB drugs.

DOI： 10.1016/j.tube.2023.102362

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In silico and in vitro Identification of Compounds with Dual Pharmacological Activity against Metionyl-tRNA Synthetase and Isoleucyl-tRNA Synthetase of Staphylococcus aureus 査読有り国際誌

Takeuchi M., Teshima M., Okubo S., Aoki S.

ChemistrySelect 8 ( 13 ) 2023年04月

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担当区分：最終著者,　責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

The spread of drug-resistant Staphylococcus aureus (S. aureus) in hospitals and communities poses a serious medical threat. This study aimed to identify aminoacyl-tRNA synthetase inhibitors with antimicrobial activity against S. aureus. In silico structure-based drug screening using docking and molecular dynamics simulations (MDS) was performed targeting S. aureus metionyl-tRNA synthetase (saMetRS). Ten candidate compounds were selected by screening a compound 3D structure library with 154,118 compounds. One compound (Compound 9) showed a strong inhibitory effect in growth inhibition studies using Staphylococcus epidermidis. From the experiments verifying the dose-dependent effect, the IC50 value of Compound 9 was determined to be 3.74 μM. MDSs predicted that Compound 9 exhibits inhibitory activity against saMetRS and S. aureus isoleucyl-tRNA synthetase, which belongs to the same subclass Ia. Compound 9 with its polypharmacological activity is not susceptible to drug resistance and is expected to have enhanced antimicrobial efficacy.

DOI： 10.1002/slct.202300460

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Identification of a Chemical Inhibitor with a Novel Scaffold Targeting Decaprenylphosphoryl-β-D-Ribose Oxidase (DprE1) 査読有り

Matsunaga T., Monobe K., Aoki S.

Infectious Disorders - Drug Targets 23 ( 5 ) 24 - 30 2023年01月

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担当区分：責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

Background: Tuberculosis is the second leading cause of death from infectious diseases worldwide. Multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis is spreading throughout the world, creat-ing a crisis. Hence, there is a need to develop anti-tuberculosis drugs with novel structures and versatile mechanisms of action. Objective: In this study, we identified antimicrobial compounds with a novel skeleton that inhibits mycobacterium decaprenylphosphoryl-β-D-ribose oxidase (DprE1). Methods: A multi-step, in silico, structure-based drug screening identified potential DprE1 inhibitors from a library of 154,118 compounds. We experimentally verified the growth inhibitory effects of the eight selected candidate compounds against Mycobacterium smegmatis. Molecular dynamics simulations were performed to understand the mechanism of molecular interactions between DprE1 and om-pound 4. Results: Eight compounds were selected through in silico screening. Compound 4 showed strong growth inhibition against M. smegmatis. Molecular dynamics simulation (50 ns) predicted direct and stable binding of Compound 4 to the active site of DprE1. Conclusion: The structural analysis of the novel scaffold in Compound 4 can pave way for anti-tuberculosis drug development and discovery.

DOI： 10.2174/1871526523666230309110705

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Establishing a parallel compound screening method and identifying novel antimicrobial compounds targeting Staphylococcus aureus dihydrofolate reductase 査読有り

Nakashima J., Takeuchi M., Kawamoto S., Monobe K., Taira J., Aoki S.

Journal of Applied Pharmaceutical Science 12 ( 8 ) 36 - 47 2022年08月

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担当区分：責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

The emergence of drug-resistant Staphylococcus aureus strains, such as methicillin-resistant S. aureus and vancomycin-resistant S. aureus, and their spread not only inside hospitals but also outside hospitals has become a major problem worldwide. In this study, we investigated novel antimicrobial compounds targeting trimethoprim-resistant S. aureus dihydrofolate reductase (TMP-resistant saDHFR). A novel screening method, called the parallel compound screening (PCS) method, was established to analyze a common population of compounds that showed top scores using two docking tools, GOLD and AutoDock Vina. Using 154,118 compounds in the structural library, we conducted a three-step in silico structure-based drug screening, including PCS, and identified nine candidate compounds targeting TMP-resistant saDHFR. The growth inhibitory effects of the candidate compounds on bacteria were examined on Staphylococcus epidermidis, a model microbial strain of S. aureus. Among the candidate compounds, two compounds showed strong growth inhibition against S. epidermidis. The IC50 values of the two compounds (6.34 and 56.94 µM) were determined. Molecular dynamics simulations predicted the direct and stable interactions between the active compounds and TMP-resistant saDHFR. The data regarding these active compounds from this study are expected to contribute to the development of new antibacterial agents against drug-resistant strains of S. aureus.

DOI： 10.7324/JAPS.2022.120805

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Establishment of in silico prediction methods for potential bitter molecules using the human T2R14 homology-model structure 査読有り国際誌

Kuriki K., Matsumoto R., Ijichi C., Taira J., Aoki S.

Chemical Biology Letters 9 ( 3 ) 2022年03月

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担当区分：責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

Bitterness is sensed by human taste receptors (hT2Rs) consisting of G protein-coupled receptors (GPCRs). The construction of an in silico evaluation system for bitter molecules using human T2R structure information will enable the identification of new bitter molecules and bitter blockers, which will contribute to food and drug development. Since the crystal structures of the hT2Rs have not been elucidated, we attempted to construct in silico discrimination methods for potential bitter molecules using the hT2R14 model structure in the GPCRdb that was constructed by the homology modelling method. Although the hT2R14 model structure was constructed using characteristics of existing bitter molecules, it was not previously clear whether it could be used for the prediction of new bitter molecules and bitter blockers. In this study, we established novel methods of predicting potential bitter molecule interactions with hT2R14 using datasets of compounds from ChemBridge and FEMA GRAS libraries. We used docking simulation tools, molecular dynamics simulation tools, structure-based machine learning (ML) tools, and sequence-based ML tools to establish potential bitter molecule prediction systems for hT2R14. Finally, we constructed novel in silico prediction systems, one of which can evaluate potential bitter molecules with high accuracy (AUC = 0.850) using consensus scoring based on the structure-based ML tools OnionNet, GNINA and BAPA.

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Identification of novel inhibitors for mycobacterial polyketide synthase 13 via in silico drug screening assisted by the parallel compound screening with genetic algorithm-based programs 査読有り

Taira J., Murakami K., Monobe K., Kuriki K., Fujita M., Ochi Y., Sakamoto H., Aoki S.

Journal of Antibiotics 2022年01月

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担当区分：責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

Identifying small compounds capable of inhibiting Mycobacterium tuberculosis polyketide synthase 13 (Pks13), in charge of final step of mycolic acid biosynthesis, could lead to the development of a novel antituberculosis drug. This study screened for lead compounds capable of targeting M. tuberculosis Pks13 from a chemical library comprising 154,118 compounds through multiple in silico docking simulations. The parallel compound screening (PCS), conducted via two genetic algorithm-based programs was applied in the screening strategy. Out of seven experimentally validated compounds, four compounds showed inhibitory effects on the growth of the model mycobacteria (Mycobacterium smegmatis). Subsequent docking simulation of analogs of the promising leads with the assistance of PCS resulted in the identification of three additional compounds with potent antimycobacterial effects (compounds A1, A2, and A5). Further, molecular dynamics simulation predicted stable interaction between M. tuberculosis Pks13 active site and compound A2, which showed potent antimycobacterial activity comparable to that of isoniazid. The present study demonstrated the efficacy of in silico structure-based drug screening through PCS in antituberculosis drug discovery.

DOI： 10.1038/s41429-022-00549-z

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Computer-Assisted Screening of Mycobacterial Growth Inhibitors: Exclusion of Frequent Hitters with the Assistance of the Multiple Target Screening Method 査読有り

Kuriki K, Taira Ji, Kuroki M, Sakamoto H, Aoki Shunsuke

The International Journal of Mycobacteriology ( Wolters Kluwer ) 2021年08月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）
Improvement of the novel inhibitor for Mycobacterium enoyl-acyl carrier protein reductase (InhA): a structure–activity relationship study of KES4 assisted by in silico structure-based drug screening 査読有り

Taira J., Umei T., Inoue K., Kitamura M., Berenger F., Sacchettini J.C., Sakamoto H., Aoki S.

Journal of Antibiotics 2020年01月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

© 2020, The Author(s), under exclusive licence to the Japan Antibiotics Research Association. InhA or enoyl-acyl carrier protein reductase of Mycobacterium tuberculosis (mtInhA), which controls mycobacterial cell wall construction, has been targeted in the development of antituberculosis drugs. Previously, our in silico structure-based drug screening study identified a novel class of compounds (designated KES4), which is capable of inhibiting the enzymatic activity of mtInhA, as well as mycobacterial growth. The compounds are composed of four ring structures (A–D), and the MD simulation predicted specific interactions with mtInhA of the D-ring and methylene group between the B-ring and C-ring; however, there is still room for improvement in the A-ring structure. In this study, a structure–activity relationship study of the A-ring was attempted with the assistance of in silico docking simulations. In brief, the virtual chemical library of A-ring-modified KES4 was constructed and subjected to in silico docking simulation against mtInhA using the GOLD program. Among the selected candidates, we achieved synthesis of seven compounds, and the bioactivities (effects on InhA activity and mycobacterial growth and cytotoxicity) of the synthesized molecules were evaluated. Among the compounds tested, two candidates (compounds 3d and 3f) exhibited superior properties as mtInhA-targeted anti-infectives for mycobacteria than the lead compound KES4.

DOI： 10.1038/s41429-020-0293-6

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Structural modification of a novel inhibitor for mycobacterium enoyl-acyl carrier protein reductase assisted by in silico structure-based drug screening 査読有り

Taira J., Nagano T., Kitamura M., Yamaguchi M., Sakamoto H., Aoki S.

International Journal of Mycobacteriology 9 ( 1 ) 12 - 17 2020年01月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

© 2020 Medknow. All rights reserved. Background: Mycobacterium tuberculosis enoyl-acyl carrier protein reductase (mtInhA) is involved in the biosynthesis of mycolic acids, a major component of mycobacterial cell walls, and has been targeted in the development of anti-tuberculosis (TB) drugs. In our previous in silico structure-based drug screening study, we identified KES4, a novel class of mtInhA inhibitor. KES4 is composed of four ring structures (A-D-rings) and molecular dynamic simulation predicted that the D-ring is essential for the interaction with mtInhA. Methods: The structure-activity relationship study of the D-ring was attempted and aided by in silico docking simulations to improve the mtInhA inhibitory activity of KES4. A virtual chemical library of the D-ring-modified KES4 was then constructed and subjected to in silico docking simulation against mtInhA using the GOLD program. The candidate compound showing the highest GOLD score, referred to as KEN1, was synthesized, and its biological properties were compared with those of the lead compound KES4. Results: We achieved the synthesis of KEN1 and evaluated its effects on InhA activity, mycobacterial growth, and cytotoxicity. The antimycobacterial activity of KEN1 was comparable to that of the lead compound (KES4), although it exhibited superior activity in mtInhA inhibition. \Conclusions: We obtained a KES4 derivative with high mtInhA inhibitory activity by in silico docking simulation with a chemical library consisting of a series of D-ring-modified KES4.

DOI： 10.4103/ijmy.ijmy_184_19

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ケモインフォマティクス手法を用いた精油構成化学成分における抗菌作用機序の予測査読有り

角崎丈司, 三重野雄貴, 浜出百合菜, 青木俊介

アロマテラピー学雑誌 16 2016年03月

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担当区分：責任著者記述言語：日本語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

CiNii Article
Identification of novel antimycobacterial chemical agents through the in silico multi-conformational structure-based drug screening of a large-scale chemical library 査読有り

Koseki Y, Kinjo T, Kobayashi M, Aoki S

Eur J Med Chem ( 60 ) 333 - 339 2013年02月

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担当区分：責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）
Aberrant structures of Parkinson’s disease-associated ubiquitin C-terminal hydrolase L1 predicted by molecular dynamics. 査読有り

Koseki Y, Kinjyo T, Kuroki M, Aoki S.

Chem Phys let ( 535 ) 163 - 168 2012年04月

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担当区分：責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1016/j.cplett.2012.03.083

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Surgical anatomy of the swine face. 査読有り

Sasaki R,Watanabe Y,Yamato M,Aoki S,Okano T,Ando T.

Lab Anim. 44 ( 4 ) 359 - 363 2010年08月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

主要雑誌
引用数　0回(2012年3月現在)

DOI： 10.1258/la.2010.009127

Scopus
A protocol for immunofluorescence staining of floating neurospheres. 査読有り

Sasaki R,Aoki S,Yamato M,Uchiyama H,Wada K,Ogiuchi H,Okano T,Ando T

Neurosci Lett. 479 ( 2 ) 126 - 127 2010年04月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

主要雑誌
引用数　1回(2012年3月現在)

DOI： 10.1016/j.neulet.2010.05.042

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Identification of a novel chemical potentiator and inhibitors of UCH-L1 by in silico drug screening. 査読有り

Mitsui T,Hirayama K,Aoki S,Nishikawa K,Uchida K,Matsumoto T,Kabuta T,Wada K.

Neurochem Int. 56 ( 5 ) 679 - 686 2010年02月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

主要雑誌
引用数　2回(2012年3月現在)

DOI： 10.1016/j.neuint.2010.01.016

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Clock genes regulate neurogenic transcription factors, including　NeuroD1, and the neuronal differentiation of adult neural stem/progenitor cells. 査読有り

Kimiwada T,Sakurai M,Ohashi H,Aoki S,Tominaga T,Wada K.

Neurochem Int. 52 227 - 235 2008年12月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

主要雑誌
引用数　3回(2012年3月現在)
G-protein-coupled receptor screen reveals a role for chemokine receptor CCR5 in suppressing microglial neurotoxicity. 査読有り

Gamo K,Kiryu-Seo S,Konishi H,Aoki S,Matsushima K,Wada K,Kiyama H.

J Neurosci. 28 ( 46 ) 11980 - 11988 2008年11月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

主要雑誌
引用数　16回(2012年3月現在)
Aberrant interaction between Parkinson disease-associated mutant UCH-L1 and the lysosomal receptor for chaperone-mediated autophagy. 査読有り

Kabuta T,Furuta A,Aoki S,Furuta K,Wada K.

J Biol Chem. 283 ( 35 ) 23731 - 23738 2008年08月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

主要雑誌
引用数　50回(2012年3月現在)
Tubulation with dental pulp cells promotes facial nerve regeneration in rats. 査読有り

Sasaki R,Aoki S,Yamato M,Uchiyama H,Wada K,Okano T,Ogiuchi H.

Tissue Eng Part A 14 ( 7 ) 1141 - 1147 2008年07月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

主要雑誌
引用数 2回(2012年3月現在)
Aberrant molecular properties shared by familial Parkinson's disease-associated mutant UCH-L1 and carbonyl-modified UCH-L1. 査読有り

Kabuta T,Setsuie R,Mitsui T,Kinugawa A,Sakurai M,Aoki S,Uchida K,Wada K.

Human Molecular Genetics 17 ( 10 ) 1482 - 1496 2008年05月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

主要雑誌
引用数　29回(2012年3月現在)
Neurosphere generation from dental pulp of adult rat incisor. 査読有り

Sasaki R,Aoki S,Yamato M,Uchiyama H,Wada K,Okano T,Ogiuchi H.

Europian Journal of Neuroscience 27 ( 3 ) 538 - 548 2008年02月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

主要雑誌
引用数　14回(2012年3月現在)
Alpha 1-adrenoceptor agonists protect against stress-induced death of neural progenitor cells. 査読有り

Ohashi H, Nishikawa K, Ayukawa K, Hara Y, Nishimoto M, Kudo Y, Abe T, Aoki S, Wada K

Eur J Pharmacol 573 ( 1-3 ) 20 - 28 2007年11月

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担当区分：責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

主要論文
引用数　3回(2012年3月現在)
Identification of novel chemical inhibitors for ubiquitin C-terminal hydrolase-L3 by virtual screening. 査読有り

Hirayama K, Aoki S, Nishikawa K, Matsumoto T, Wada K

Bioorg Med Chem 15 ( 21 ) 6810 - 6818 2007年11月

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担当区分：責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

主要論文
引用数　13回(2012年3月現在)
Melanocortin receptor 4 is induced in nerve-injured motor and sensory neurons of mouse. 招待有り査読有り

Tanabe K, Gamo K, Aoki S, Wada K, Kiyama H

J Neurochem 101 ( 4 ) 1145 - 1152 2007年05月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

主要論文
引用数　6回(2012年3月現在)
Neuroprotective role of bradykinin because of the attenuation of pro-inflammatory cytokine release from activated microglia. 査読有り

Noda M, Kariura Y, Pannasch U, Nishikawa K, Wang L, Seike T, Ifuku M, Kosai Y, Wang B, Nolte C, Aoki S, Kettenmann H, Wada K

J Neurochem 101 ( 2 ) 397 - 410 2007年04月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

主要論文
引用数　27回(2012年3月現在)

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口頭発表・ポスター発表等

in silico ドッキングシミュレーション手法を用いた結核菌polyketide synthase 13に対する新規抗菌薬の探索

Kahori Murakami, Shunsuke Aoki , Rina Takeda

日本バイオインフォマティクス学会年会 2021年09月日本バイオインフォマティクス学会

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開催期間： 2021年09月27日 - 2021年09月29日記述言語：英語開催地：オンライン国名：日本国
Identification of novel chemical inhibitors for hepatocyte growth factor by in silico structure-based drug screening.

Koseki Y

CBI/JSBi/Omix 2012合同大会生命医薬情報学連合大会 CBI/JSBi/Omix

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開催期間： 2012年10月14日 - 2012年10月17日記述言語：英語開催地：東京
Identification of novel potential antibiotics for Staphylococcus by Structure-Based Drug Screening

小林舞子

第30回バイオ情報学研究会 (SIG-BIO)

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開催期間： 2012年08月09日記述言語：日本語開催地：福岡
分子動力学計算によるUCH-L1変異体の構造変化予測

小関祐司

第30回バイオ情報学研究会情報処理学会

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開催期間： 2012年08月09日記述言語：日本語開催地：福岡
in silico structure-based drug screening手法を用いたMycobacteriumに対する新規抗菌作用化合物の同定

金城知広

in silico structure-based drug screening手法を用いたMycobacteriumに対する新規抗菌作用化合物の同定情報処理学会

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開催期間： 2012年08月09日記述言語：日本語開催地：福岡
ドッキングシュミレーション手法を用いたスタフィロコッカス属細菌に対する新規抗菌薬同定の試み

小林舞子

日本生物物理学会九州支部例会日本生物物理学会

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開催期間： 2011年12月04日記述言語：日本語開催地：福岡
in silico Structure-Based Drug Screening 手法を用いた結核菌Enoylacyl carrier protein reductase に対する新規抗菌作用化合物の同定

金城知広

日本生物物理学会九州支部例会日本生物物理学会

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開催期間： 2011年12月04日記述言語：日本語開催地：福岡
in silico Structure-Based Drug Screening 手法を用いた結核菌に対する新規抗菌作用化合物の同定

金城知広

日本生物物理学会九州支部例会日本生物物理学会

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開催期間： 2011年12月04日記述言語：日本語開催地：福岡
Aberrant structure of Parkinson's disease-associated Ubiquitin C-terminal hydrolase L1 predicted by molecular dynamics

Koseki Y

CBI/JSBi 2011 合同大会 CBI/JSBi

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開催期間： 2011年11月08日 - 2011年11月10日記述言語：日本語開催地：神戸
Identification of novel chemical inhibitors for angiogenic growth factors by in silico structure-based drug screening

Tsuruta K

CBI/JSBi 合同大会 CBI/JSBi

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開催期間： 2011年11月08日 - 2011年11月10日記述言語：日本語開催地：神戸
in silico Structure-Based Drug Screening手法による結核に対する新規抗菌化合物同定の試み

小関祐司

日本生化学会九州支部例会日本生化学会

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開催期間： 2011年05月21日 - 2011年05月22日記述言語：日本語開催地：福岡
FDA認可薬構造ライブラリを用いたブルーリ潰瘍に対する治療薬のStructure-Based Drug Screeningによる探索

山田淳美

日本生化学会九州支部例会日本生化学会

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開催期間： 2011年05月21日 - 2011年05月22日記述言語：日本語開催地：福岡
血管新生因子群を標的とした in silico structure based drug screening による新規薬剤探索の試み

鶴田康一朗

日本生化学会　九州支部例会日本生化学会

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開催期間： 2011年05月21日 - 2011年05月22日記述言語：日本語開催地：福岡
Virtual screeningによるNK1-heparin複合体を標的とした新規薬剤の同定の試み

出水園優也

BMB2010(第33回日本分子生物学会年会、第83回日本生化学会大会　合同大会) 日本分子生物学会、日本生化学学会

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開催期間： 2010年12月07日 - 2010年12月10日記述言語：日本語開催地：神戸
Identification of a novel chemical inhibitor for epidermal growth factor receptor by in silico virtual screening

Yuji Koseki

CBI Annual Meeting 2010

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開催期間： 2010年09月15日 - 2010年09月17日記述言語：日本語開催地：東京
Quantitative analysis tools for secondary structuretrajectory result of protein molecular dynamics

Masato Kuroki

CBI学会2010年大会 CBI

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開催期間： 2010年09月15日 - 2010年09月16日記述言語：日本語開催地：東京
Identification of a novel chemical inhibitor for VEGF receptor by virtual screening

Tsuruta,K

CBI学会2010年大会 CBI

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開催期間： 2010年09月15日記述言語：日本語開催地：東京
Identification of novel anti-biotics for tuberculosis by virtual screening

出水園優也

CBI Annual meeting 2010 CBI

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開催期間： 2010年09月15日記述言語：日本語開催地：東京
Degradable Poly (Dl-Lactide-Co-Glycolide) (Plga) Artificial Nerve　Conduits With Dental Pulp Cells Promotes Facial Nerve Regeneration

R. Sasaki

EUROPEAN ASSOCIATION FOR CRANIO-MAXILLO-FACIAL SURGERY EUROPEAN ASSOCIATION FOR CRANIO-MAXILLO-FACIAL SURGERY

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開催期間： 2010年09月13日記述言語：英語開催地： Belgium
Identification of a novel chemical inhibitor for NGF by virtual screening

Takahiro Shibata

Neuro2010 日本神経科学会

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開催期間： 2010年09月03日記述言語：日本語開催地：神戸
血管内皮細胞増殖因子(VEGF)の立体構造を用いたvirtual screeningによる機能阻害化合物の同定

鶴田康一朗

日本分子生物学会第10回春季シンポジウム

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開催期間： 2010年06月07日 - 2010年06月08日記述言語：日本語開催地：宮城
PACAP/PAC1システムによる神経系前駆細胞の増殖, 並びにアストロサイト新生への機能的制御

西本美香

CREST研究領域「脳の機能発達と学習メカニズムの解明」第5回領域内研究報告会独立行政法人科学技術振興機構

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開催期間： 2008年03月05日記述言語：日本語
virtual screeningによるUCH-Lファミリー活性調節剤探索研究

平山和徳

第２回ナノバイオテクノロジー連携群成果報告会内閣府

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開催期間： 2007年12月05日記述言語：日本語
神経変性タンパク質の細胞局所場に於ける動態・フィブリル化のイメージングに基づく効率的な医薬品評価系の開発

松田知巳

第２回ナノバイオテクノロジー連携群成果報告会. 内閣府

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開催期間： 2007年12月05日記述言語：英語開催地：東京
Virtual screeningによるUCH-L3の新規阻害剤同定

平山和徳

第35回構造活性相関シンポジウム

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開催期間： 2007年11月15日記述言語：日本語開催地：京都
Clock genes regulate neurogenic transcription factors and the neuronal differentiation of adult neural stem/progenitor cells.

Kimiwada T

Neuro2007 神経科学会

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開催期間： 2007年09月11日記述言語：日本語開催地：神奈川
Identification of novel UCH-L1-potentiating compounds by in silico drug screening.

Hirayama K

Neuro 2007 神経科学会

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開催期間： 2007年09月10日記述言語：日本語開催地：神奈川
歯髄を用いた癌切除後顔面神経欠損の再生

佐々木亮

第１６回日本癌病態治療研究会日本癌病態治療研究会

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開催期間： 2007年06月27日記述言語：英語開催地：東京
G-蛋白共役型受容体(GPCR)を標的とした神経系前駆細胞の細胞表面マーカーの探索

青木俊介

神経組織の成長・再生・移植研究会第２２回学術集会神経組織の成長・再生・移植研究会

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開催期間： 2007年05月26日記述言語：日本語開催地：岡山

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科研費獲得実績

テーラーメード構造ライブラリからの新規トリクロサン類縁抗結核化合物の有機合成展開

研究課題番号：26460145 2014年04月 - 2017年03月基盤研究(C)
初期-後期エンドソーム移行による神経突起伸長制御機構の解明

研究課題番号：19500338 2007年04月 - 2010年03月基盤研究(C)

担当授業科目（学内）

2023年度指導型演習
2023年度実験演習
2023年度講究
2023年度細胞情報伝達演習ML
2023年度創薬ケモインフォマティクス特論
2023年度細胞情報伝達演習LE
2023年度学際情報特別実験及び演習Ⅲ
2023年度学際情報講究Ⅲ
2023年度創薬ケモインフォマティクス
2023年度生命化学情報工学プロジェクト研究
2023年度生命化学情報工学実験Ⅱ
2022年度創薬ケモインフォマティクス

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科目区分：学部専門科目
2022年度細胞情報伝達演習ML
2022年度創薬ケモインフォマティクス特論
2022年度細胞情報伝達演習LE
2022年度創薬ケモインフォマティクス
2022年度生命化学情報工学プロジェクト研究
2022年度生命化学情報工学実験Ⅱ
2021年度細胞情報伝達特論
2021年度創薬ケモインフォマティクス
2020年度細胞情報伝達特論
2020年度創薬ケモインフォマティクス
2019年度細胞情報伝達特論
2019年度科学技術英語Ⅰ
2019年度生体情報学
2018年度生体情報学
2018年度科学技術英語Ⅰ
2018年度細胞情報伝達特論
2017年度科学技術英語Ⅰ
2017年度生体情報学
2017年度計算機システムⅡ-２
2017年度計算機システムⅡ-１
2017年度細胞情報伝達特論
2016年度細胞情報伝達特論
2016年度科学技術英語Ⅰ
2016年度生体情報学
2016年度計算機システムⅡ-２
2016年度計算機システムⅡ-１
2015年度計算機システムⅡ-１
2015年度計算機システムⅡ-２
2015年度生体情報学
2015年度科学技術英語Ⅰ
2015年度ライフサイエンス実験 I
2015年度細胞情報伝達特論
2014年度生体情報学
2014年度ライフサイエンス実験 I
2014年度細胞情報伝達特論
2014年度計算機システムⅡ
2013年度細胞情報伝達特論
2013年度ライフサイエンス実験 I
2013年度生体情報学
2012年度計算機システムⅡ
2012年度生体情報学
2012年度細胞情報伝達特論
2012年度ライフサイエンス実験Ⅰ

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社会貢献活動（講演会・出前講義等）

情報工学のもたらす新世界探訪－情報工学の可能性は∞－

役割：講師

九州工業大学福岡県立小倉南高等学校 2023年12月20日

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対象：高校生

種別：出前授業
技術者ってかっこよくって、わるくない－アニメや映画にみる技術者の姿－

役割：講師

九州工業大学山口県立下関南高等学校 2023年12月13日

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対象：高校生

種別：出前授業
情報工学のもたらす新世界探訪－情報工学の可能性は∞－

役割：講師

九州工業大学熊本県立東稜高等学校 2023年09月14日

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対象：高校生

種別：出前授業
第30回九工大わくわく科学教室

役割：司会,　企画,　運営参加・支援,　実演

九州工業大学　飯塚市第27回九工大わくわく科学教室 2023年08月18日

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対象：小学生,　中学生

種別：セミナー・ワークショップ
情報工学のもたらす新世界探訪－情報工学の可能性は∞－

役割：講師

九州工業大学熊本県立鹿本高等学校 2023年07月13日

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対象：高校生

種別：出前授業
情報工学のもたらす新世界探訪－情報工学の可能性は∞－

役割：講師

九州工業大学山口県立萩高等学校 2023年07月05日

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対象：高校生

種別：出前授業
技術者ってかっこよくって、わるくない－アニメや映画にみる技術者の姿－

役割：講師

九州工業大学北九州市立篠崎中学校 2023年06月22日

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対象：中学生

種別：出前授業
理数科課題研究発表会

役割：運営参加・支援

嘉穂高校理数科課題研究発表会 2023年02月01日

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対象：高校生,　教育関係者

種別：その他
小学生・はじめてのプログラミング教室

役割：運営参加・支援

九州工業大学小学生・はじめてのプログラミング教室 2023年01月29日

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対象：小学生

種別：セミナー・ワークショップ
情報工学のもたらす新世界探訪－情報工学の可能性は∞－

役割：講師

九州工業大学福岡県立小倉南高等学校 2022年12月21日

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対象：高校生

種別：出前授業
FIRST LEGO League 2022-2023 福岡予選大会

役割：運営参加・支援

NPO法人青少年科学技術振興会 FIRST Japan FIRST LEGO League 2022-2023 福岡予選大会おおぞら高校福岡キャンパス 2022年12月18日

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対象：小学生,　中学生,　教育関係者,　保護者,　企業,　市民団体

種別：その他
第29回九工大わくわく科学教室

役割：司会,　企画,　運営参加・支援,　実演

九州工業大学　飯塚市第27回九工大わくわく科学教室 2022年12月10日

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対象：小学生,　中学生

種別：セミナー・ワークショップ
技術者ってかっこよっくて、わるくない－アニメや映画にみる技術者の姿－

役割：講師

九州工業大学愛媛県立西条高等学校 2022年12月08日

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対象：高校生

種別：出前授業
技術者ってかっこよっくて、わるくない－アニメや映画にみる技術者の姿－

役割：講師

九州工業大学福岡県立博多青松高等学校　通信制 2022年11月12日

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対象：高校生

種別：出前授業
情報工学のもたらす新世界探訪－情報工学の可能性は∞－

役割：講師

九州工業大学新田青雲中等教育学校 2022年11月09日

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対象：中学生,　高校生

種別：出前授業
第28回九工大わくわく科学教室

役割：司会,　企画,　運営参加・支援,　実演

九州工業大学　飯塚市第27回九工大わくわく科学教室 2022年10月22日

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対象：小学生,　中学生

種別：セミナー・ワークショップ
星ヶ丘小学校　親子科学教室

役割：運営参加・支援

九州工業大学星ヶ丘小学校星ヶ丘小学校　親子科学教室 2022年09月30日

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対象：小学生,　保護者

種別：セミナー・ワークショップ
技術者ってかっこよっくて、わるくない－アニメや映画にみる技術者の姿－

役割：講師

九州工業大学佐賀県立伊万里高等学校 2022年09月29日

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対象：高校生

種別：出前授業
技術者ってかっこよっくて、わるくない－アニメや映画にみる技術者の姿－

役割：講師

九州工業大学久留米信愛高等学校 2022年08月19日

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対象：高校生

種別：出前授業
第27回九工大わくわく科学教室

役割：司会,　企画,　運営参加・支援,　実演

九州工業大学　飯塚市第27回九工大わくわく科学教室 2022年08月07日

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対象：小学生,　中学生

種別：セミナー・ワークショップ
新宮高校　プログラミングセミナー

役割：企画,　運営参加・支援

九州工業大学　新宮高校新宮高校　プログラミングセミナー 2022年08月01日 - 2022年08月03日

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対象：高校生,　教育関係者,　学術団体

種別：出前授業
夏休み親子ふれあい教室「わくわく科学教室」

役割：司会,　企画,　運営参加・支援

九州工業大学　中間市夏休み親子ふれあい教室「わくわく科学教室」 2022年07月30日

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対象：小学生,　保護者

種別：セミナー・ワークショップ
情報工学のもたらす新世界探訪－情報工学の可能性は∞－

役割：講師

九州工業大学熊本県立人吉高等学校 2022年07月08日

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対象：高校生

種別：出前授業
情報工学のもたらす新世界探訪－情報工学の可能性は∞－

役割：講師

九州工業大学愛知県立中村高等学校 2022年07月01日

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対象：高校生

種別：出前授業
情報工学のもたらす新世界探訪－情報工学の可能性は∞－

役割：講師

九州工業大学福岡県立明善高等学校 2022年02月19日

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対象：高校生

種別：出前授業
情報工学のもたらす新世界探訪－情報工学の可能性は∞－

役割：講師

九州工業大学福岡県立講倫館高等学校 2021年06月04日

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対象：高校生

種別：出前授業
技術者ってかっこよくって、わるくない－アニメや映画にみる技術者の姿－

2014年11月13日

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対象：高校生

種別：出前授業

福岡県立早筑前高等学校
技術者ってかっこよくって、わるくない－アニメや映画にみる技術者の姿－

2014年10月24日

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対象：中学生

種別：セミナー・ワークショップ

九州国際大学付属中学校
情報工学のもたらす新世界探訪－情報工学部の可能性は∞－

2014年09月09日

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対象：高校生

種別：出前授業

熊本県立天草高等学校
情報工学のもたらす新世界探訪－情報工学部の可能性は∞－

2014年07月14日

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対象：高校生

種別：出前授業

福岡県立東鷹高等学校
技術者ってかっこよくって、わるくない－アニメや映画にみる技術者の姿－

2014年07月11日

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対象：高校生

種別：セミナー・ワークショップ

山口県立下関南高等学校
技術者ってかっこよくって、わるくない－アニメや映画にみる技術者の姿－

2014年06月12日

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対象：高校生

種別：出前授業

福岡県立早良高等学校
技術者ってかっこよくって、わるくない！－アニメや映画にみる技術者の姿－

2013年07月10日

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対象：高校生

種別：出前授業

島根県立大田高等学校
技術者ってかっこよくって、わるくない！－アニメや映画にみる技術者の姿－

2013年06月12日

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対象：高校生

種別：出前授業

福岡県立中間高等学校

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